1、小白鼠的基因序列和人类的相似，一些医学的科研和临床实验都是由小白鼠来完成的。当中以小白鼠做遗传学实验最好，因为它的全基因组和人类的相似度极高，小白鼠的染色体和人类非常接近（小白鼠是40对，人类是42对），很多人类难以治愈的疾病可以在小白鼠身上找到相似性状，从而加以实验发现治病基因。
2、此外，小白鼠遗传基因的稳定性，同一窝纯种小白鼠，有着几乎完全一样的遗传特性，这对科学试验是很方便的，排除了个体对象的差别，说简单点就是，同一窝小白鼠都像是克隆出来的一样，用不同的药品试验，都象是在同一个个体上采取的，方便比对，不会因为试验个体的差别而产生其它多余的结果。
3、培育出的小鼠几乎完全没有个体差异(生理上)，而在一般的自然种群中，同种动物间的个体差异是很大的(尽管外表相同)，主要表现在先天的身体素质上。生理上没有个体差异是否意味着气质上没有差异尚不明了，不过选择纯系实验白鼠主要还是为了尽可能的减少先天的个体差异。简单说，即用白老鼠是因为白老鼠都是纯系的，相当于人类近亲交配生出来的儿子得了白化病，纯系的老鼠作出来得实验平行性好。
4、数量充足，许多实验需要统计学分析，这就要求一定的数量，大白鼠和小白鼠，特别是小白鼠，在人工繁殖条件下，能满足这一要求。其次，老鼠繁殖周期快，质量小，对各种刺激的敏感性较强，且容易标记。所以药物或现象在它的身上可以比较快的显示出来。这样就大大缩短了科学家实验的时间成本。
5、成本低。从单只动物的价格上讲，一只纯种小白鼠才十几元，一只大猩猩要几万元；从饲养成本上讲，小白鼠仅食少量饲料，而猴子、猩猩等不仅吃得多，还得给它们“定制宵夜”，比如水果等；另外，饲养小白鼠，一个小笼子，一个房间可以喂养上百只小白鼠。
