石斛种类很多，石斛根的长短大小也千差万别。石斛根的长度一般在40-60厘米，就粗细而言，一般是1-2毫米。石斛根由根冠、生长点、伸长区、成熟区、老熟区五部分组成。
根冠位于根尖的最先端，主要起保护生长点的作用；生长点长约1~2毫米，全部由分生细胞构成，能不断的进行分裂，增生新细胞，并不断分化为根的表皮、表层、中柱；伸长区位于生长点方，长约几毫米，由生长点分裂细胞，经过伸长和初步分化而成。
是根伸长区细胞分化的主要部分；成熟区位于伸长的上方，由伸长区细胞分化成熟，根与根菌共生，无根毛，只能靠共生菌固定空气中的氮和分解附祝表皮的动植物残体提供养料。石斛根的中柱细韧，表层呈肥厚肉质状，充满着水分和空气，有着防御干旱和贮藏养分的作用。
