非法占用土地罪立案标准是：非法占有农田五亩以上、非法占用基本农田以外耕地十亩以上、造成基本农田五亩以上污染的等，对于犯罪嫌疑人非法占用土地达到上述标准的，可以追究其刑事责任。
非法占用土地罪立案标准，是依据《最高人民法院关于审理破坏土地资源刑事案件具体应用法律若干问题的解释》第三条 违反土地管理法规，非法占用耕地改作他用，数量较大，造成耕地大量毁坏的，依照刑法第三百四十二条的规定，以非法占用耕地罪定罪处罚：
(一)非法占用耕地“数量较大”，是指非法占用基本农田五亩以上或者非法占用基本农田以外的耕地十亩以上。
(二)非法占用耕地“造成耕地大量毁坏”，是指行为人非法占用耕地建窑、建坟、建房、挖沙、采石、采矿、取土、堆放固体废弃物或者进行其他非农业建设，造成基本农田五亩以上或者基本农田以外的耕地十亩以上种植条件严重毁坏或者严重污染。
根据《刑法》第四百一十条之一规定，国家机关工作人员徇私舞弊，违反土地管理法规，滥用职权，非法批准征用、占用土地，或者非法低价出让国有土地使用权，情节严重的，处三年以下有期徒刑或者拘役;致使国家或者集体利益遭受特别重大损失的，处三年以上七年以下有期徒刑。
加重处罚事由 犯非法批准征用、占用土地罪而致使国家或者集体利益遭受特别重大损失的，是本罪的加重处罚事由。这里的特别重大损失，根据前引司法解释的规定，是指具有下列情形之一的：
(1)非法批准征用、占用基本农田二十亩以上的;
(2)非法批准征用、占用基本农田以外的耕地六十亩以上的;
(4)非法批准征用、占用土地，造成基本农田五亩以上、其它耕地十亩以上严重毁坏的;
(5)非法批准征用、占用土地造成直接经济损失五十万元以上等恶劣情节的。
对于非法占用土地的行为，必须是对国家的土地权益造成了侵犯，涉及到相关事项的处理和认定，应当严格基于实际的违法事实来进行办理，特别是涉及到情节严重的，如造成了大量的土地污染或者毁坏的，是需要从严处罚的。
在我国的经济发展的过程中，土地是我国农村经济发展和城市经济发展的重要的资源，此时对于侵害土地的使用，或者是非法侵占他人的土地的行为，我国的法律法规是予以严厉的打击的，侵占土地的犯罪行为是我国的侵占罪的一种，但是又存在特定之处。
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