刑事自诉案件如果调解处理，肯定是原告已经同意调解，双方达成了调解协议。这个时候法院就因为原告不再追究加害人的责任，认定调解协议的法律效力了。
所以说，刑事自诉案件调解的，加害人就不再承担刑事责任了。除非有证据证明这个调解协议是违法达成的。
依据我国相关法律的规定，人民调解员进行调解后，达成协议的，当事人认为不需要制作调解书，可以采取口头协议，口头调解协议自各方当事人达成协议之日起生效。法院调解作为民事诉讼法的一项基本原则和人民法院审理民事案件的重要方式，在司法实践中具有广泛的适用性，因其高效快捷解决纠纷受到法官、律师和当事人的认可。但工作中经常会遇到法官调解时在各种因素影响下达成协议并在调解笔录签字的当事人，回家后突然反悔觉得调解结果自己不能接受，希望反悔的案件。
三、调解协议怎么起诉无效
如果不是人民法院主持下达成的调解协议，除有关正式部门(基层司法所或公证部门)的以外一般都不发生可以申请法律执行的法律效力。但是如果是在人民法院主持下达成的调解协议，一般在当事人签收后即发生法律效力。生效法律调解协议必须符合的条件：双方自愿;是非分明;不违反法律规定。由此可以说明在下述几个情况下法院调解协议不生效：一是违反双方自愿原则，违反当事人意志强行调解的;二是是非不分，明显偏袒有过错一方的;三是违反有关法律规定的。不过要能够证明调解协议是在以上情况下作出的，这个证明过程甚至比调解过程难度还要大。
自诉案件的调解协议是有效的，按照协议的内容进行相关的执行，可以不需要再承担其他的刑事责任，如果不是人民法院主持下达成的调解协议，一般都不发生可以申请法律执行的法律效力，如果是在人民法院主持下达成的调解协议，一般在当事人签收后即发生法律效力。
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