承担民事责任的方式主要有：停止侵害、排除妨碍、消除危险、返还财产、恢复原状、赔偿损失、支付违约金、消除影响、恢复名誉、赔礼道歉等。
以上承担民事责任的方式，可以单独适用，也可以合并适用。
《中华人民共和国刑法》
第二百一十九条的规定，实施侵犯商业秘密行为，给商业秘密的权利人造成重大损失的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金造成特别严重后果的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。”
1、商业秘密权利人的侵权行为而遭受的损失。这主要是权利人可计算的财产、收入方面的损失。包括：
(1)研制开发成本，如花费的时间、金钱和付出的财力等;
(2)现实利益损失，如生产成本的降低、销售额的提高、利润率的增加等;
(3)将来可得利益的合理预期。
2、以侵权人因侵权行为获得的利润为赔偿额。
3、未能确定权利人的损失或者侵权人所获利润的，可参照商业秘密许可使用或者花费的的合理费用来确定。
4、定额赔偿。定额赔偿是由人民法院根据案件的具体情况酌情确定的赔偿额。
在知识产权案件中，经常会出现原告的损失和被告的获利均无法查明的情况，根据《中华人民共和国专利法》第六十五条规定：“权利人的损失、侵权人获得的利益和专利许可使用费均难以确定的，人民法院可以根据专利权的类型、侵权行为的性质和情节等因素，确定给予一万元以上一百万元以下的赔偿”。
在侵犯商业秘密罪侦办的过程当中，如果犯罪嫌疑人可以主动对企业进行赔偿，在取得企业谅解的情况下，虽然不可能被免于刑事处罚，但从轻处罚的可能性还是很大的，嫌疑人不愿意主动赔偿的，企业可以提起附带民事诉讼。
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