女性淋病特别是子宫颈有淋病双球菌感染时，可合并上生殖系统的感染，造成较为严重的淋病，如淋菌性盆腔炎，包括子官内膜炎、输卵管炎、输卵管卵巢囊肿、盆腔脓肿、腹膜炎等，而感染淋病后男女的并发症是不一样的。
1、淋病性龟头包皮炎 ： 由淋病的脓性分泌物刺激龟头及包皮内叶所致。开始局部烧灼、瘙痒感、微痛、包皮水肿、内叶糜烂。龟头潮红及轻度糜烂，重症者包皮全部呈现显著浮肿，不能上翻，龟头肿大，可继发炎性包茎。
2、淋病性副尿道炎：副尿道大都开口于尿道外口周围，或系带部位，或阴茎背侧沿正中线皮肤。淋病患者如有此种副尿道时，极易被波及，发生明显炎症。脓性分泌物中可查出淋菌，为淋病传染源之一。
3、淋病性尿道狭窄;慢性淋病经过数月或数年后，易引起尿道狭窄，最初病人毫无感觉，逐渐排尿不畅，尿意频数，尿丝细弱无力，不能直射，至排不出或仅滴而出。进行性尿道狭窄，若不早期治疗其后果极不良、有时竞致生命危险。
4、淋病性前列腺炎： 分为急性与慢性两种：
慢性前列腺炎，急性前列腺炎未彻底治疗，易转为慢性前列腺炎。表现为会阴部有坠感、压痛、尿意频数，常有腰痛。肛诊前列腺肥大，多处有硬结，触之有压痛，按摩时有粘液分泌物，检查有白细胞。
5、淋病性附睾炎： 本症系淋菌经过射精管侵入附睾所致，为急性后尿道淋病最常见的合并症。表现为附睾肿胀，触及表面有坚硬结节，常有放射状疼痛，急性期体温上升到39摄氏度左右。
6、淋病性精囊炎，淋菌经射精管、输精管或淋巴道侵入。会阴部坠胀感，排尿排便时加剧，有疝痛向输精管及睾丸放射，尿液澄清。
7，在女性婴儿和青春前期少女，可有外阴部刺激，红斑，水肿伴脓性阴道分泌物及直肠炎。患儿可诉尿痛或排尿困难，家长可发现其内裤有污染。
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