男子割包皮可以防止感染性病，一般割过包皮的男人疱疹风险、感染的风险更低，患与生殖器癌症的风险比未割包皮者低35%。乌干达研究者在得出上述结论的时候同时强调，这只有部份的保护力，防止性病的重点仍在进行安全性行为。
研究者认为可能是包皮的黏膜层会让细菌穿透下方的皮肤细胞，当割掉包皮后，覆盖龟头的皮肤变得较坚硬，有助于避免细菌进入。稍早的研究资料显示，只有一名性伴侣且为割包皮者的伴侣，发生宫颈癌的风险是未割者伴侣的一半。
2006年12月，美国国家卫生研究院中止了两项男性包皮环切术的临床试验，因为早期数据显示，该过程显著降低了艾滋病病毒的传播，关于该课题的研究成果被刊登在《Lancet外科医生》杂志。在这两项随机进行的实验中，受测者包括来自拉卡伊、乌干达、基苏木和肯尼亚的7780名HIV阴性的男性，研究人员发现，当与女性有性行为时，接受过外科包皮环切术的男性比未接受者受HIV感染的几率至少要低51%。
《Lancet》编者将这一发现称之为 HIV防治的新时代 。
众所周知，艾滋病的传播途径有三种：性行为传播、血液传播和母婴垂直传播。其中通过性行为传播而感染艾滋病的占80%左右。成年男性中，估计有70%的感染者是通过经阴道性行为获得，在非洲这一比例甚至超过90%。所以人们在努力探求男性对艾滋病的易感因素，希望可以降低艾滋病在成年男性中的传播几率。
其实在艾滋病刚刚开始在世界流行的时候，Fink教授在1986年就提出通过男性的包皮环切术可以减少艾滋病的发生。经过多年的临床研究和实验室研究，已经得出未行包皮环切术的男性是艾滋病感染的危险因素之一。近年在非洲的乌干达和肯尼亚两国分别进行的大规模的临床前瞻性随机对照研究更加明确地指出：男性包皮环切手术可以显著减少非洲男性通过异性性行为传播艾滋病的风险，并建议可以通过行包皮环切术来配合其他手段共同预防艾滋病的发生。
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