咪喹莫特治疗尖锐湿疣的疗效相当的不错，咪喹莫特软膏用于治疗水痘-带状疱疹及Ⅰ型、Ⅱ型单纯疱疹的感染，包括初发和复发的生殖器疱疹。可用于阿昔洛韦的所有适应证（如乙肝、尖锐湿疣、全身性疱疹）。吸收非常迅速，5min血药浓度达到峰值，水解半衰期为7～8min，吸收后，广泛分布于全身14个组织，可达胃、小肠、肝、肾、皮肤等组织，尤以淋巴结、皮肤中的浓度最高，是治疗病毒性皮肤病的首选药物。所以咪喹莫特乳膏可以用于治疗湿疣。
目前认为机体免疫功能特别是细胞免疫功能低下是尖锐湿疣感染和复发的重要原因，咪喹莫特是集抗病毒和提高机体免疫力双重功效于一体的祛疣药物，它能够在用药局部诱生a-干扰素（IFN-a）、a-肿瘤坏死因子（TNF-et）、白细胞介素（IL-1a、IL-1B、IL-6、IL-8、IL-10）等多种细胞因子及相关产物，从而对治疗尖锐湿疣疗效较好，
由于咪喹莫特是一种仅供外用的祛疣药物，病例的正确选择非常重要，对于疣体数目 5个，单个疣体直径及疣体团块直径~ 5mm者适用于咪喹莫特的治疗。女性患者应用咪喹莫特的治愈率及总有效率要高于男性患者，但经统计学处理，无显著性差异。此外，应用咪喹莫特的临床疗效与治疗时间呈正相关，足够的疗程是取得满意临床疗效的关键所在。
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