小儿先天性巨结肠导致食欲下降病症常常导致营养不良发育迟缓，长期腹胀便秘，可使患儿食欲下降，影响了营养的"吸收，粪便淤积使结肠肥厚扩张。小儿先天性巨结肠导致食欲下降患者应详细地了解该手术方式的优点，以及肠道准备对于整个手术的重要意义，使家长积极配合。同时，在治疗的时候，应改善患儿营养状况，纠正贫血或低蛋白血症。患儿进食营养丰富、富含热量、易消化的少渣食物，避免进高纤维食物，防止在灌肠中容易造成堵管。
结肠造瘘：通过小儿先天性巨结肠导致食欲下降的手术，人工建立的使结肠内容物暂时或永久排出体外的通道。新生儿经保守治疗失败或患者病情严重或不具备根治术。
根治手术：虽为短段巨结肠亦应手术治疗。如患儿发生急性小肠结肠炎、危像或营养发育障碍，不能耐受一次根治手术者，应行静脉补液输血，改善一般情况后再行根治手术。
保守治疗：超短形先天性巨结肠病儿，新生儿等痉挛肠段短、便秘症状轻者。包括定时用等渗盐水洗肠（灌洗出入量要求相等，忌用高渗、低渗盐水或肥皂水），扩肛、甘油栓、缓泻药，并可用针炙或中药治疗。治疗小儿先天性巨结肠导致食欲下降病症6个月后，再行根治手术。
