番荔枝的育苗个别也以实生播种繁殖为主，近年来也在实验无性滋生的方式，如靠接、压条、盾形芽接等。嫁接法常用的砧木有共砧、牛心番荔枝、刺番荔枝等。
番荔枝过去用实生法育苗，目前主要还是用实生法。因实生法简单、易掌握，1年便可育成合格苗出圃，且定植后2～3年即能投产，基本能保持优良种法，故仍广泛使用。但实生苗毕竟有变异，特别是不同品种人工授粉后，变异会更大，因此，应积极推广嫁接育苗，试验其他营养繁殖法育苗。
(一)实生育苗
实生法培育的实生苗除直接供种植外，也作培育嫁接苗的砧木。
1.采种及种子处理
种子应来自优良品种、丰产、优质母株上大而形端正的果实，若作实生苗直接种植，更要重视种子来源，最好来自同品种人工授粉的果实。待果实充分成熟才采收取种。
种子取出后洗净，浮去不实粒，晾干即播，或充分晒干后妥善保存待翌年春播。
2.播种时期及播种方法
在冬季气温较高地区，番荔枝最好是秋季采收后取种子，晾干即播。新鲜种子发芽率高，苗木生长期长，有利于培育壮苗。但由于番荔枝幼苗对霜冻特别敏感，故在我国大部分地区，要做好冬季防寒。在广州及以南地区，一般在秋分前后播种。春播以当地低温阴雨天气已过、晴暖较稳定后为好。在广州地区，一般3月下旬至4月播种为适期。番荔枝种子不耐贮藏，一般采种后即播或贮藏至下年播，若再常温贮藏1年才播，则基本不发芽。
经贮藏的番荔枝种子，播种前要晒，以促进发芽。苗圃应选向阳、冷空气不积聚、排水良好、肥沃的砂质壤土。施腐熟有机质肥和石灰作基肥后，按常规修沟起畦，务求畦面平整。用条播或撒播法，每亩用种子6～7.5公斤(每公斤约4000粒)。用河沙或细土覆盖、稍压实后盖草，充分淋水。要注意保湿，又严防水分过多。发芽后，分次揭开盖草，以免压弯幼苗，适当追施薄肥以促进幼苗生长，冬季搭矮棚、最好是塑料薄膜密封矮棚防霜冻害，促进苗木生长。
(二)嫁接育苗
番荔枝嫁接育苗目前仍不普遍，但由于嫁接法能保持母株优良种性，能在短期内大量繁育营养系后代，保证种植材料的一致性，便于良种的迅速推广。因此，应是今后主要的常规育苗方法。
砧木用本砧(即用同品种或不同品种的番荔枝)，生活力强，嫁接亲和力强。若用其他种类的番荔枝作砧木，应经过试验。用芽接法或枝接法，春季或秋季均可。
(三)其他育苗方法
