自从全国垃圾分类运行以后，各个城市和地区就纷纷加紧了垃圾分类的计划和管理，南京市也在积极的进行垃圾分类的规划。南京市垃圾分类管理办法于2013年4月1日南京市人民政府第4次常务会议审议通过，2013年4月5日南京市人民政府令第292号公布，自2013年6月1日起施行。对生活垃圾分类管理遵循减量化、资源化、无害化的方针和城乡统筹、科学规划、综合利用的原则，实行政府主导、社会参与、全市统筹、属地负责。市人民政府建立和完善生活垃圾分类管理工作的综合考核制度，将生活垃圾分类管理工作情况纳入区人民政府考核指标，并定期公布结果。
南京市将建立生活垃圾服务企业信用评价制度。对生活垃圾分类收集、运输和处置服务企业的从业条件、作业实施、履行协议、台账和数据报送，以及分类收集和处置的设施运营状况和处置效果进行评议。评议结果纳入企业信用档案，作为从事城市生活垃圾经营性收集、运输和处置作业服务企业招标的重要依据。
2019年，南京市为了垃圾分类管理做了很多努力和运行方案，南京市会将以街道为主体来整体推进单位、公共场所等开展垃圾分类的活动。目前，南京市已经确定了12个街道作为城市第一批全面的开展垃圾分类的街道。今年年初，南京市便全面运行了党政机关垃圾分类工作，分别设立了一个垃圾分类的工作小组，进行了一次工作动员大会，并且对全体职工进行了一次宣传培训，最后一同制定了工作方案，进行了具体的部署实施。
南京市依据城市精细化管理的要求，对于垃圾分类也将按照垃圾精细化处理的模式，对于垃圾箱进行进一步的调整。目前，已基本完成对垃圾箱的垃圾分类标志的规范调整，对于垃圾分类的标志用图形和文字将垃圾的种类进行了标识，这样就方便市民更直观的识认垃圾分类的投放规则。
