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元古代结束后，叠层石逐渐衰落了。人们推测这是因为这一时期地球上出现了动物，是它们吃了这类藻类，致使其数量迅速减少。
在距今26亿年的元古代，地球上的蓝细菌曾经十分繁盛。这时的蓝细菌不仅种类多，数量多，而且生长过程中可由其细胞外的灰质加上藻丝黏结周围的碳酸盐碎屑，从而共同形成藻类特有的沉积结构。这种结构不仅能帮助藻类生长，而且能增强抗海水侵袭的能力。
藻类是一层层排列的，再往上生长，且在不同季节、不同年月生长速度不同，因而留下疏密、明暗不同的层理，包括弧形、锥形或平整的层状，其形成的沉积结构被称为叠层石。这个时期形成的叠层石十分繁盛，在世界各地都可以找到。
元古代结束后，叠层石逐渐衰落了。人们推测这是因为这一时期地球上出现了动物，是它们吃了这类藻类，致使其数量迅速减少，即便形成叠层石其规模已很小，而寒武纪之后的地层中叠层石更是罕见。现生的叠层石在澳大利亚西海岸以及中美洲的巴哈马群岛等地的浅海区尚有广泛分布。在其他地方的湖泊、海洋中，蓝细菌虽很常见，但大部分成为鱼虾等的口中餐，只有在水体富营养化时，它们才会暴发或迅速增殖，造成藻类泛滥成灾，但这与叠层石形成的环境已经完全不同了。
