1、清洗缸壁。鱼缸用了一段时间都会在玻璃壁上产生污垢甚至苔藓，可以用磁刮器将鱼缸玻璃上的苔藓和圬垢方便地刮干净。
2、清洗过滤系统。对于过滤系统的清洗，第一层是过滤棉，第二层是生化棉，第三层 玻璃环（陶瓷环、生物石等），第四层 活性炭（吸氨石、麦饭石等）。第一层是属于物理过滤，主要是将水中的固体残渣阻挡住，所以特别容易脏，清洗也是以这一层为主，其他几层通常很少清洗，常洗反而容易失去硝化菌。清洗时，一是要注意切不可搓洗，也不必要求洗得过分干净，更不可直接用自来水洗，可以借助于鱼缸换水的机会，使用换出的水进行清洗，否则附着在滤棉上的硝化细菌会被您彻底消灭，以至失去生物过滤的作用。
3、鱼缸的消毒。给鱼缸消毒可以用高锰酸钾液，高锰酸钾，又称ＰＰ粉，为强氧化剂，遇有机物即放出新生态氧，有杀灭细菌作用。其杀菌力极强，常用浓度为1：2000—1：5000，（即1克高锰酸钾加2L-5L水）的溶液冲洗。
4、注意的是，在配制溶液时要考虑时间，高锰酸钾放出氧的速度慢，浸泡时间一定要达到5分钟才能杀死细菌。配制溶液要用凉开水，消毒后用水稍加清洗即可使用。
