1、恒温保存：巢脾从蜂箱中取出来后要将蜂蜜摇尽，然后放入蜂箱隔板外侧让蜜蜂将蜂蜜舔食干净并用起刮刀将巢框上的蜂胶、蜡瘤、污迹和霉点等刮干净，最后即可将处理干净的巢脾放在20～30℃的恒温环境中保存。
2、熏蒸保存：巢脾在保存过程中易受到鼠害和虫害，因此可将巢脾用点燃的硫磺粉熏蒸后保存，具体做法是将巢脾集中在空蜂箱中，然后盖上蜂箱的盖子并在箱底点燃硫磺粉熏闷1～2小时即可杀死藏匿在巢脾中的虫卵。
3、继箱保存：继箱保存法是保存巢脾最有效的办法，原因是继箱中经常有工蜂爬上去清理和驱赶虫害，加之继箱中不管是温度还是湿度都和巢箱几乎完全一样，因此保存在继箱中的巢脾根本不用担心霉变、生虫等问题。
综上所述，巢脾是蜜蜂能正常生存和繁衍的物质基础，事实上蜜蜂不管是哺育育虫还是储备食物都离不开巢脾，如何保存巢脾是每个养蜂人都必须掌握的技能，一般建议用继箱保存巢脾或硫磺粉熏蒸后再保存。
