1、忌空腹饮用：蜂蜜柠檬茶中富含有机酸等酸性物质，加之喝蜂蜜柠檬茶还能刺激胃部大量的分泌胃酸，若长期空腹饮用易因胃酸过多而引发胃溃疡甚至胃穿孔等胃肠疾病，事实上蜂蜜柠檬茶一般都建议在饭后1～2小时再喝。
2、忌高温冲泡：蜂蜜中的活性物质对温度非常敏感且高温下易失去活性，例如水温高于60℃蜂蜜中少数活性物质便会失去活性，若水温高于80℃大多数活性物质都将失去活性，因此冲蜂蜜柠檬茶要等水温低于60℃后再加蜂蜜。
3、忌过量饮用：蜂蜜柠檬茶中富含葡萄糖和果糖等单糖，单糖虽然相对不易转化成脂肪，但不是说单糖就完全不能转化成脂肪，若长期过量饮用也易因单糖摄入过量而引起肥胖，另外长期过量喝蜂蜜柠檬茶还易导致胃酸过多。
4、忌冲泡过浓：蜂蜜柠檬茶中富含有机酸等酸性物质，若冲泡得过浓极易因胃酸过多而引发胃溃疡甚至胃穿孔等胃肠疾病，同时蜂蜜柠檬茶中还富含葡萄糖和果糖等糖类物质，若冲泡过浓也极易因糖分摄入过量而越喝越肥胖。
综上所述，自制蜂蜜柠檬茶的禁忌主要有以下四个，其一是空腹饮用会因胃酸过多而引发胃肠疾病，其二是过量饮用会因糖分摄入过量而导致肥胖，其三是高温冲泡会因活性物质失活而降低营养价值，其四是冲泡得过浓会引起胃酸过多且易引起肥胖。
