罗汉鱼的品种也非常繁多，主要有以下几类：金花罗汉鱼、珍珠罗汉鱼、马骝罗汉鱼、德萨斯罗汉鱼、花角罗汉鱼等等。不同品种的罗汉鱼有不同的特点，但对养殖环境的要求并没有太大的区别。目前市场上卖的罗汉鱼一般来说都是杂交并且改良过的，含有多种血统。
1、金花罗汉鱼：这个品种的罗汉鱼出现的时间是比较早的。不过，这个品种的稳定性是比较差的，也就是在这个品系中的诸多品种之间都具有非常大的差异。一般来说，它们的头看起来都有向前探的倾向，眼睛以白色和金色为主。这个品系中包含红金花罗汉鱼、太阳金花罗汉鱼等等。
2、珍珠罗汉鱼：这个品系是市场中比较常见的一种，基因的稳定性是比较好的。而且，这个品系中的大部分繁殖都比较容易，而且也容易改良。这个品系的罗汉鱼头部一般是上扬的，有红眼圈，眼睛是向外凸出的。这个品系中包括白化珍珠罗汉鱼、无斑珍珠罗汉鱼等等。
3、马骝罗汉鱼：这个品系最早的时候是在马莱出现的。这个品系中的品种都比较稀少，因而它的价格也是比较高的。它的眼圈也是红色的，背鳍一般是不拉丝的，身体比较方正。这个品系中的品种诸如经典马骝罗汉鱼、原始马骝罗汉鱼等等。
4、德萨斯罗汉鱼：这个品系也是经过改良的，它的基因比较好，外观也比较好看。它的长度一般是在20-30厘米之间，身体比较扁，头部比较低。这个品系中包含的品种有黄金德萨斯罗汉鱼、紫色德萨斯罗汉鱼等等。
5、花角罗汉鱼：简称“花罗汉”。它的眼睛微凹，眼睛一般是白色、红色或者橙色的。这个品种的罗汉鱼性情都是比较凶的，包括花财神、花和尚罗汉等品种。
罗汉鱼含有诸多品系，而且不同的品系中又包含不同的品种。不同的品种各有特点，无法判断哪个最好。根据不同的标准判定，对于哪个品种最好这个问题的回答也是不一样的。比如，若是说最贵的一个品种，那么自然是马骝罗汉鱼。
