1、东晋的灭亡是先爆发了一场农民起义，然后又碰上了权臣篡位。在这个过程当中，有个叫刘裕的将领，逐渐掌握了大权，最后取而代之。
2、要是想细说东晋灭亡原因的话，恐怕就得从东晋建立的时候开始说起了。西晋中后期，因为司马家的几个王爷夺权，导致边疆空虚，北方游牧民族趁虚而入。公元316年，随着前赵攻破长安，晋愍帝投降，后又被杀，西晋自此灭亡。于此同时，司马懿的曾孙司马睿，逃亡南方，在许多士族的拥立下，登基称帝，建立了东晋。
3、不过，因为司马睿是在几个大士族的拥立之下，才得以称帝立国。所以东晋从开国那天起，就呈现出了皇权不振的现象。就算是东晋的开国皇帝司马睿，也没办法完全控制国家，只能与几个大士族联手，共同分享皇权。这其中，尤以琅琊王氏最为势大，所以后世便有了‘王与马公天下’的说法。
4、另外，因为西晋灭亡的时候，太过惨烈，北方更是完全被游牧民族占领。所以，在西晋灭亡的同时，很多北方的大士族，也开始纷纷南下，转移自己的家族。这些南下的士族，在当时被称之为侨族。而原本居住在江南的士族，因为当年这里曾经归东吴管辖，所以也被称之为吴族。
5、自从东晋建立开始，侨族和吴族的斗争，就没有停止过。此外，士族和皇族的斗争，以及士族和寒门的斗争，更是十分严重。而这种斗争，也进一步加剧了东晋的内耗，导致东晋虽然存在了上百年的时间，但整体实力却一直比较弱。
6、在东晋开国的同时，东晋将军祖逖，自告奋勇，请求率军北伐，收复故土。因为当时司马睿刚刚上位，根本不敢给祖逖兵权，最后只是给了一些粮草和布匹充作军资。但是，祖逖却凭着自己的才能和一腔热血，在接下来的几年里，招募了大量的军队，收复了大片土地。但是，四年之后，因为祖逖功劳过大，司马睿担心他会造反，于是直接撤掉了祖逖的兵权。祖逖失去兵权之后，眼见北伐无望，最后被活活气死。
7、就在祖逖刚刚去世之后，东晋内部的大权臣王敦，便发动了政变，攻入京城，彻底架空了司马睿。这位东晋的开国皇帝，仅仅在位6年，便在忧愤之中去世。司马睿去世后，其子司马绍即位。就在司马绍刚刚即位之后，王敦企图篡位，但却忽然病死了。王敦死后，司马绍趁机剿灭叛党，终于暂时稳住了司马家的江山。
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