如何处理畜禽粪便，变废为宝，实现畜牧业的可持续发展，是科技工作者和社会各界面临的重大课题。不过在这之前需要对其家畜粪便污染水源的危害等进行了解。
在某些地区，当作物不需要额外养分时，高密度要以氨态氮和有机氮形式存在，这些形式很容易流失或侵蚀表面水。自然情况下，大多数表面水中总的氨态氮超过标准约0.2mgL将会毒害鱼类，氨态氮的毒性随水的酸性和水温而变化，在高温碱性水条件下，鱼类毒性条件是0.1mgL。如果有充足的氧，氨态氮能转变成硝态氮，进而溶解在水中，并通过土壤渗透到地下水。
研究表明，随着粪肥的施用，区域内地下水中的NO3-N的污染物会增加，硝酸盐下渗到地下水的数量与所施用的粪便呈一种函数关系。美国环保署规定公共 用水硝态氮的最高标准为10mgL。同时，水体中过多的N会引起水体富营养化，促使藻类疯长，争夺阳光、空间和氧气，威胁鱼类、贝类的生存，限制水生生物和微生物活动中氧的供给，危害水产业;影响沿岸的生态环境，也影响水的利用和消耗。人若长期或大量饮用硝态N超标的水体，可能诱发癌症;6月龄以下的新生婴儿饮用这种水可能患高铁血红蛋白症。研究表明，深夏和秋天，畜禽粪便的陆地运用率很可能是水源N污染的关键影响因素。
畜禽粪便中P通常随雨水流失或通过土壤侵蚀而转移到表面水区域，据研究发现，P是导致水体富营养化的重要元素。P进入水体使藻类和水生杂草不正常生长，水中溶解氧下降，引起鱼类污染或死亡，过量的磷在大多数内河或水库是富营养化的限制因子。美国环保署(USEPA)推荐由点源排放进入湖泊或水库的水中P不超过0.05mgL，不是由点源直接排放进入湖泊或水库的水中P不超过0.1mgL。畜禽粪便中有机质比通常的市政污水浓度高50到250倍，我国广州市的畜禽饲养业废水排放量虽然只有生活污水量的1.25%左右，但其中CODcr的排放量是生活污水的1.5倍 。有机质也主要通过雨水流失到水体，有机质进入水体，使水体 变色、发黑，加速底泥积累，有机质分解的养分可能引起大量的藻类和杂草疯长;有机质的氧化能迅速消耗水中的氧，引起部分水生生物死亡，如在水产养殖环境中，经常因氧的迅速耗尽引起鱼死亡。此外，用有机质含量高的畜禽粪水灌溉稻田，易使禾苗陡长、倒伏，稻谷晚熟或绝收;用于鱼塘或注入江河，会导致低等植物(如藻类)大量繁殖，威胁鱼类生长。
畜禽粪便中含有大量源自动物肠道中的病原微生物和寄生虫卵，据报道，畜禽场排放的污水，平均每1mL中含有33万个大肠杆菌和69万个大肠球菌;沉淀池每升污水中含有高达190多个蛔虫卵和100多个毛首线虫卵。这些病原微生物和寄生虫卵进入水体，会使水体中病原种类增多、菌种和菌量加大，且出现病原菌和寄生虫的大量繁殖和污染，导致介水传染病的传播和流行。特别是在人畜共患病时，会引发疫情，给人、畜带来灾难性危害。在研究接纳灌溉水的田地地下水中的细菌时，发现土壤基质的过滤会大幅度减少粪便中大肠杆菌的数量，细菌在水体沉积物里可能存活几个星期。 另外，畜禽粪便中激素对水体的潜在污染也不容忽视。在美国切萨皮克海湾流域的几条河流中，检测出了与畜禽粪肥归田有关的增长性荷尔蒙丸激素和雌激素。
温馨提示，家畜粪便污染水源危害是非常大的，如果你想要了解更多的固体废弃物安全小知识，比如人畜固体废弃物该如何处理等，可以关注本站。
