水资源数量的多少和质量的优劣，直接影响到生态环境系统的质量。因此，如何从水资源开发、利用、保护、管理的角度，针对生态环境保护需求，提出生态环境保护战略性对策和措施，无疑具有重要的战略意义。
水生态保护措施
1.首先应该提高水资源利用效率，建设节水型社会。
我国有 17 个省、自治区、直辖市发布了用水定额，实行计划用水;农业节水灌溉面积已达到3.2 亿亩。2000-2004年，全国农田实灌面积用水量亩均减少 29 立方米， 降低 6.1%; 万元 GDP 用水量减少 211立方米，降低34.6% 。
2.加强水利水电工程环境影响评价。
积极推动水电建设的有序发展，国家能源发展战略和电力发展方针由积极开发水电调整为在保护生态的基础上有序开发水电。
3.积极开发水环境污染治理技术
对已经受到污染的水体进行治理，并不断开发新的污染治理。技术目前现有的水环境污染治理技术有下凹式绿地、透水铺装、砂滤、土壤渗滤、人工曝气增氧、跌水曝气、生物强化、生物链、稳定塘、雨水利用塘、生物景观塘、人工湿地、前置库、生物浮床、缓冲带、生态沟渠等。
4.生境修复与生物多样性保护技术
主要包含河流蜿蜒度构造技术、河流横断面多样性修复技术、河道内栖息地加强技术、生态型边坡技术、生态清淤技术、水系连通技术、河湖岸线控制技术、过鱼设施、增殖放流、迁地保护、“三场”维护技术、分层取水技术、过饱和气体控制技术。
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