目前，海洋开发活动缺乏综合的、长远的规划，综合效益比较差，导致海洋生态受到破坏。人类对某些海洋生物的过度捕捞，导致海洋生物资源数量减少，质量降低，也使部分物种濒临灭绝。有些海岸工程建设和围海造田缺乏科学论证，破坏了海岸环境和海岸带生态系统。
从1970年代末开始，中国近海环境日趋恶化，主要体现在近海富营养化加剧，海洋生态灾害严重;围填海失控，沿海海洋生态服务功能严重受损;渔业开发利用过度，资源种群再生能力下降;陆源入海污染严重，海洋生态环境持续恶化;流域大型水利工程过热，河口生态环境负面效应凸显等等。
从管理方面来看，我国缺少国家海洋可持续发展战略以及管理协调机制。此外，法律法规体系不完善、政策交叉、执法力不够等，都是制约合理应对海洋生态问题的因素。
国际上在海洋生态环境管理方面有很多经验值得我们借鉴，例如从20世纪90年代末期起，国际社会为防止陆地活动对海洋环境日益严重的影响，提出“从山顶到海洋”的海洋污染防治策略，强调将海洋综合管理与流域管理衔接和统筹，对跨区域、跨国界海洋污染问题建立区域间协调机制。
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