现代生态农业与传统生态农业的最大区别在于生态系统物质循环方式和能量传递方式不同，现代生态农业的特点如下：
现代生态农业的特点
1.整体性：一个生态系统内包括许多子系统，形成多层结构，按生态学和生态经济学规律，把种植业、养殖业、加工业、运销业组成综合农业经营体系，整体协调发展。生态农业重视系统的协调，包括生物之间、生物和非生物环境。
2.地域性：按地域分布规律，因地制宜发挥各自优势。
3.高效低成本：由于各子系统被充分利用，物质循环再生，实行多种经营，合理施用化肥、农药，使生态农业系统整体生产能力提高，成本降低，产业链加长，安置劳动力增多，农民收入提高。
4.精确调控：在现代生态农业系统中，人类可以根据市场需求对系统内的生物品种结构、产品结构和产业结构进行调整;可以运用信息技术，精确、及时地输入能量和物质，使系统的生产水平保持最佳状态;可以运用生物技术提高生物转化率和生物产品的利用率，提高生产效率
5.建立城乡互作的复合生态系统：城市作为农产品的消费地，是农业生态系统的消费者，而农村是城市生活物质废弃物的转化者，只有把二者紧密地联系起来，才能实现生态良性循环。
6.现代化的物质循环方式和能量传递方式：现代化的生活方式使生态系统中物质循环的一部分通过水体进行，以水为载体实现部分物质的循环和再利用。能量传递中，厌氧发酵产生沼气供人类生活需要，在现代生态农业中居重要地位。
7.改善生态环境：通过物质循环再生，各种副产品及废弃物得到利用，并减少化肥、农药的用量，从而减少了对环境的污染和破坏，提高了农村生态环境质量。
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