中国生态农业的定义是在生态学和生态经济学指导下，将中国传统农业的精华同现代科学技术结合，依据整体、协调、循环、再生的原则，运用生态工程的手段因地制宜地改进或优化设计的农业生态—经济—社会系统，实现生态效益、经济效益和社会效益的统一。
中国生态农业的基本内涵是按照生态学原理和生态经济规律，应该根据土地形态制定适宜土地的设计、组装、调整和管理农业生产和农村经济的系统工程体系。它要求把发展粮食与多种经济作物生产，发展大田种植与林、牧、副、渔业，发展大农业与第二、三产业结合起来，利用传统农业精华和现代科技成果，通过人工设计生态工程、协调发展与环境之间、资源利用与保护之间的矛盾，形成生态上与经济上两个良性循环，经济、生态、社会三大效益的统
中国生态农业与西方那种完全回归自然、摒弃现代投入的“生态农业”主张完全不同。它强调的是继承中国传统农业的精华---废弃物质循环利用;规避常规现代农业的弊病，单一连作，大量使用化肥、农药等化学品，大量使用化石能源等;通过用系统学和生态学规律指导农业和农业生态系统结构的调整与优化，如推行立体种植，病虫害生物防治，改善其功能;以及推进农户庭院经济等。在从村到县的各级生态农业的试点上，曾普遍取得良好的效果。
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