根据研究显示，石斛组培苗的最佳移植时期是根长在0.5-1.0cm时。栽种前，须将石斛组培苗放在室内炼苗20～25天左右，之后用清水洗净组培苗根部的培养基质。用0.1%的百菌清稀释液喷洒消毒，以预防组培苗根腐烂。
石斛为丛生植物，多株种植比单株种植长势更好，以3株1丛种植更适宜。栽种时，可按每株15cm×20cm的行距种植。移栽时，可在基质上挖深2—3cm的小洞。轻轻将炼苗、出瓶洗净后的组培苗根部放入小洞，使根系自然舒展，注意千万不要弄断石斛的肉质根。盖土时，轻提幼苗，使苗根系能与基质充分接触，基质以覆盖住根部为宜，浇足定根水即可。
栽种时间以每年的3～6月为佳。研究发现，在最佳生长季节移栽，石斛试管苗的大小与成活率关系不明显，选择在这段时间内栽种组培苗成活率较高。加之这段时间，气候更适合石斛生长，移栽后的石斛组培苗生长得更加健壮。
