中医学认为六味地黄丸可以滋阴补肾，用于肾阴虚，主要表现为腰膝酸软、头昏、耳鸣、盗汗、潮热、手脚心热、牙齿松动、舌燥咽痛，以及小儿囱门不合、舌红少苔等。六味地黄丸也能配合山药、山茱萸、伍泽泻来吃，与三药配合，滋养肝脾肾，称为“三补”。
现代科技发展，六味地黄丸的功效得到了护展。目前有研究，将六味地黄丸用于抗肿瘤和抗细胞突变的作用，可减轻和对抗化疗药的副作用，可以降低血脂，对高血压、心律失常等有一定的辅助作用；慢性肾炎、糖尿病、肺结核、甲状腺功能亢进、中心性视网膜炎、无排卵性功能性子宫出血、更年期综合征等疾病，如果发现是肾阴虚为主，遵医嘱配合用六味地黄丸。
六味地黄丸也能根据体质来调配，如果在服用期间出现了食欲不振、大便稀等问题，则应该停药，向医生询问解决方法，同时服用香砂六君丸、木香顺气丸等健脾养胃药。
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