沼气在生活中是有害的，短时间吸入沼气没什么影响，但如果长期在周围吸入沼气后，会造成头晕或氧气不足的现象，严重的话有可能会中毒。所以，平时在生活或工作环境中，不要选择沼气地带。
沼气完全燃烧会产生无毒的水和二氧化碳。 但是，过量的二氧化氮呼吸会导致头晕和氧气供应不足。
沼气燃烧不完全将使一氧化碳（有毒）易于与血红蛋白结合形成羧化血红蛋白，使血红蛋白丧失携带氧气的能力和功能，严重时可导致组织窒息死亡。 一氧化碳对整个身体，特别是对大脑皮层有毒性作用。
沼气的成分是甲烷，燃烧后应产生二氧化碳，人们通常吸入的大多数气体应该是氧气，如果闻到太多的二氧化碳气体，很容易窒息其中一种。另一个解释可能是甲烷没有完全燃烧产生一氧化碳，一氧化碳是有毒气体，长期吸入可轻易使人窒息。
必须确保在呼吸过程中发生沼气中毒时，应立即将中毒的患者转移到空气流通良好的地方，并应解开衣服的纽扣和皮带，以保持呼吸道通畅。同时，注意保暖以防感冒和继发感染。轻度中毒患者可畅通无阻，并及时转移到空气新鲜的地方。一般来说，不需要特殊的治疗，可以根据情况服用曲痛片和柠檬烯等药物，中毒患者应通过人中，涌泉等穴位刺激，并及时送医院抢救。
