现在全国做农产品电商有很多，但是有80%的农产品电商是在做亏本经营，剩下的20%勉强可以持平，但是利润也不大。农产品入驻电商听上去很美，但是实际操作起来却会产生各种运营问题。
先拿物流来说，如果创业者是乡镇的，每天要把农产品发货到城里，没有属于自己的物流链，光靠快递成本是非常大的，如果客户单价少于200块，加上物流成本和商品损耗，那也是致命的痛。如果客单价上不去而物流成本降不下来，想要盈利只能是一种幻想。除了考虑物流成本，速度也是问题，正常运输还好，一旦天气或交通受阻，生鲜食品的保鲜期有又短，对顾客和自己造成的损失不可估量。
如果农产品电商是一个人单打独斗，那么想要发展下去是很困难的事情，自己起早贪黑但农产品销量却并不影响，做农产品电商不是一个小成本的创业，好的农产品需要种植经验、技术（保鲜和冷藏）、物流、客户，光靠自己一个人是无法完成的。最终能在电商中存活下来的创业者都不是一个人，而是一个小团队或一个公司。
很多农产品电商的货源除了自己种植以外，都是以定向采购的方式和种植基地合作，缺乏一体化的采购基地，想要按照市场导购来有计划种植产品在现在看来还是一种远景，生产出高端的农产品也是痴人说梦，所以霓虹国才有那么多高端农产出口到中国。了解一下星巴克，它不仅实现了基地的整合、需求的协同、还有有一条从咖啡豆种植、降水、土壤等一系列管理的供应链，这才是强大的原因。
客户维护也是一个难题，如果自己的服务可以到达他们要求那还好说，一旦他们对自己的产品和服务不满意，就不会再产生第二次订单了，所以客户是一把双刃剑，可以让你成功也可以将你推入谷底。增加客户粘性是农产品电商要认真解决的问题。
冷链也是农产品电商无法回避的问题，不仅仅自己要建库房，还需要冷藏+冷冻的配送车，没有这些设备就算再好的商品送到客户的手里也会出问题，但这些收入都不是一般农产品电商可以承担的，而且后期成本回收周期长，会给日常运营带来很多压力。
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