人类肠道微生物群是指一个高度多样化的微生物生态系统，它与宿主有共生关系。分子氢和二氧化碳是由厌氧生态系统中的发酵代谢产生的。大约150 多年前，分子氢已被确定为人体肠道气体的主要成分，随后的研究详细说明了大肠杆菌在食物发酵过程中产生的氢气。传统上，氢被认为是一种生物惰性气体，内源性氢通过肠胃或结肠粘膜吸收进入血液循环，然后通过呼气排出体外。然而，最近的研究表明，内源性氢在人体内具有联合效应，作为一种抗炎生物分子，表现出心脏保护作用或防止组织损伤。
产生氢气的细菌是革兰氏阴性细菌。McKay等人1982年的《病理微生物免疫扫描学报》发表的“人体肠道厌氧菌产甲烷和氢气的研究”一文中报道了他们采用气相色谱法对多种人体肠道厌氧菌的液上气培养物进行采样和分析的研究结果。梭菌属的菌株产氢量最大，厌氧球菌居中，拟杆菌属的产氢量最少。只有极少数菌株产甲烷，尽管在一株梭菌、产气荚膜梭菌和溶组织梭菌中检测到少量甲烷。这些厌氧菌可能与几种胃肠道疾病有关，其中肠内有氢气或甲烷积聚（McKay, et al. 1982.）。
日本名古屋大学的研究人员我们使用气相色谱法测定了代表七个主要肠道细菌群/属/种的七种细菌菌株的产氢量。球形布劳氏菌（Blautia coccoides）和细梭状芽孢杆菌（Clostridium leptum）产生的氢气量最大。大肠杆菌（Escherichia coli）和脆弱类杆菌（Bacteroides fragilis）是第二类产生氢气的细菌，其产氢量比球形布劳氏菌低34-93倍。伪链状双歧杆菌（Bifidobacterium pseudocatenulatum）和微小阿托波姆菌（Atopobium parvulum）构成了第三组，其产氢量比球形布劳氏菌低559-2164倍。干酪乳杆菌（Lactobacillus casei）没有产生可检测到的氢（Suzuki, et al. 2018.）。
