说到古格王朝，其最神秘的地方就是这是一个文化成熟灿烂的王国，但是却诡异的在一夜之间突然彻底消失了。在接下来的几个世纪里，人们几乎不知道它的存在，也没有人类活动摧毁它的建筑和街道。它完全保留了被毁的场景。然而，唯一令人费解的是这一切是如何发生的。
据记载，从16世纪下半叶到17世纪初，古格逐渐衰落。最重要的原因是古格王室与僧团的矛盾日益尖锐。此时，古格的对外战争仍在继续，消耗了大量的国力和财富，尤其是古格与邻国拉达克之间时断时续的边境冲突，进一步对古格王朝造成了深刻的打击。与此同时，古格周边的一些小国也经常联合起来，出兵反对古格王国，这使得古格王朝更是火上浇油。
因此，有人指出，古格王朝的消失是由于战争。然而，从记载和调查的结果来看，战争造成的屠杀和掠夺不足以摧毁古格文明。但是事实上，烟消云散的古格王国很快变成了一个巨大的废墟。
还有人认为，古格当地地理环境的迅速恶化是其消失的主要原因。古格王朝崛起的自然因素是曾经繁盛一时的绿洲。随着绿洲环境的逐渐恶化，现在古格遗址的沙漠化程度非常严重，只留下了一点点的土林和戈壁，几乎不可能养活大量的人口。
但问题仍然还是这10万人去了哪里，若是他们已经迁移走了，一定有知道他们历史的后代。可惜的是，如今古格老地方只有十几户人家守卫着一座空城废墟，但这些人并不是古格的后裔。
也有人说，除了战争，扎达的地理环境迅速恶化是主要原因。比如自然灾害、瘟疫等。都不足以让繁荣的文明突然消失的彻彻底底，没有留下任何令人信服的证据。
古格的秘密似乎很难在短时间内解开。在沙漠中消失的古老国家有很多，这些难以解开的历史谜团，只有靠跨学科的学者共同努力探索才能破解。
古格王朝以精冶和金银制品制造而闻名。据说他们铸造的佛像是用金、银、铜等不同的原料制作而成，制作精美，完全无缝，自然成型，其价值甚至超过了纯金佛像。其中最令人惊叹的是名为“古格银眼”的铜像，被认为是佛像中的精品。它非常罕见，因为它很少在世界上流通。很长一段时间，没有人知道它是什么。
直到1997年夏天，古格出土了一尊精美的铜像。铜像有三只眼睛，中间的眼睛在前额作为垂直的眼睛。三眼眼球均采用镀银工艺，在金色铜像背衬下银光闪闪。这就是所谓的“古格银眼”，看来确实名不虚传。
