离婚时确定孩子的抚养权归属问题，可以双方先进行协商，达成一致意见，签署离婚协议;如果无法协商，对于两个孩子来说，抚养权应该一人一个，未取得抚养权的一方，要支付孩子的抚养费。
离婚后两个孩子的抚养权双方可以协商确定，协商不成的，由法院判决。夫妻生育两个孩子的，一般情况下一方可以取得一个孩子的抚养权。
1、如果在今后的抚养期内，一方不适合抚养小孩，另一方可以到法院重新起诉，要求变更小孩抚养权。若当事人一方想同时取得两个孩子的抚养权，自己应该有比对方更适合孩子健康成长的条件，并且对方存在不适合抚养孩子的情况，这样才可能同时取得两个孩子的抚养权。
2、离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。
二、离婚抚养权的判定原则有什么?
离婚孩子抚养权的判定原则：如果是不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已经满两周岁的子女，父母双方对其抚养问题协商不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。
父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。
离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。
婚内有两个孩子，抚养权可以一人一个，离婚判决孩子的抚养权，首先考虑的就是孩子的年纪，对于不满两周岁的孩子，抚养权归女方所有。对于2~8岁之间的孩子，可以由父母双方协商，确认孩子的抚养权。对于八岁以上的孩子，要考虑孩子的意愿。
离婚要想得到两个孩子的抚养权，必须起诉到司法机关，并提供利于子女成长的证据来处理，司法机关会对相关情况进行审查，以利于子女成长为原则对抚养权进行判决处理，具体情况结合实际而定。
如果夫妻双方想要解除婚姻关系的，此时是需要处理很多问题的，比如说夫妻共同债务的分担、孩子的抚养权归属等，此时关于孩子的抚养权的归属问题，是可以由双方协商解决的，如果协商不成的可以向人民法院起诉，由人民法院根据各方面的因素判决。
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