不会，不查前科案底，生孩子和案底无关。办理准生证一般要求提供男女双方的户口簿原件和复印件，夫妻双方各自的身份证和结婚证原件。
申请人携带身份证、户口簿、结婚证、子女出生医学证明等有效证件以及女方近期孕检证明，并同时附加符合特殊情况再生育一个子女的证明材料，持《服务证》到女方户籍所在地村(居)民委员会提出申请。
《中共中央国务院关于实施全面两孩政策改革完善计划生育服务管理的决定》
第八条
改革生育服务管理制度。实行生育登记服务制度，对生育两个以内(含两个)孩子的，不实行审批，由家庭自主安排生育。改进再婚等情形再生育管理。优化办事流程，简化办理手续，全面推行网上办事，进一步简政便民。依法依规查处政策外多孩生育。
延伸阅读：
羁押会不会留案底
刑事拘留会不会留案底
嫖娼被抓会不会留案底？
