人民法院不能主动将案件退回人民检察院补充侦查，特殊情况，人民法院主动建议的情形仅限于“发现被告可能有自首、立功等法定量刑情节”，即人民法院只能是有利于被告人的量刑情节。除此之外，人民法院均无权直接将案件退回人民检察院补充侦查。另外，为保障被告人权益，此处规定为“应当建议”，而且没有次数限制。
根据《刑事诉讼法》第165条和第166条的规定，在法庭审理过程中，检察人员发现提起公诉的案件需要补充侦查，并提出补充侦查建议的，人民法院可以延期审理，补充侦查应当在1个月以内完毕。
最高人民法院关于执行《中华人民共和国刑事诉讼法》若干问题的解释第一百五十七条规定：在庭审过程中，公诉人发现案件需要补充侦查，提出延期审理建议的，合议庭应当同意。但是建议延期审理的次数不得超过两次。可见，法庭审理阶段补充侦查必须由人民检察院依法提出建议，人民法院才能作出延期审理的决定。
最高人民法院执行《中华人民共和国刑事诉讼法》若干问题的解释第一百五十七条规定：在庭审过程中，公诉人发现案件需要补充侦查，提出延期审理建议的，合议庭应当同意。但是建议延期审理的次数不得超过两次。
补充侦查后的案件处理问题，最高人民法院在执行《中华人民共和国刑事诉讼法》若干问题的解释第一百五十七条规定：法庭宣布延期审理后，人民检察院在补充侦查的期限内没有提请人民法院恢复法庭审理的，人民法院应当决定按人民检察院撤诉处理。
1、补充侦查的情况有两种。即如果是由公安机关侦查终结，人民检察院审查之后，需要补充侦查时，既可以决定将案件退回公安机关补充侦查，也可以决定自行侦查，必要时可以要求公安机关协助。但是，如果是人民检察院自行侦查终结的案件需要补充侦查的，则不能退由公安机关补充侦查。
2、根据《刑事诉讼法》第 140条及最高人民检察院《规则》第268条和第269条规定，对于退回公安机关补充侦查的案件，应当在一个月以内补充侦查完毕;人民检察院审查起诉的期限从案件补充侦查完毕移送起诉之日起重新计算。人民检察院审查起诉中决定自行侦查的，应当在审查起诉期限内侦查完毕。
3、补充侦查的次数不得超过2次。这既指退回公安机关补充侦查的案件，也包括人民检察院决定退回侦查部门补充侦查的案件。
4、经过补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定。目的在于维护犯罪嫌疑人的合法权益，防止案件久拖不决，提高诉讼效率。
公安机关也会对触犯法律的行为进行调查，如果在调查后已经对犯罪嫌疑人的犯罪事实充分掌握后，也是可以将案件移交至检察院进行审理，如果检察院认为需要重新进行侦查时，也是可以进行补充侦查，补充侦查的具体时间一般会在一个月内完成，必要时可以申请延期。
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