如果是存疑不起诉不算是刑事处罚。因为如果存疑不起诉此时是没有刑事处罚的。
而且检察院在这个时候是没有收集足够的证据的，所以这个时候是不予起诉的。但是如果有证据足够的话，那么此时检察院会有可能对嫌疑人提起诉讼的。
根据我国《刑法》的规定，刑事处罚包括主刑和附加刑两部分。主刑有：管制、拘役、有期徒刑、无期徒刑和死刑。附加刑有：罚金、剥夺政治权利和没收财产。所有的刑事处罚必须经过人民法院判决。
不起诉是人民检察院通过审查起诉，认为案件缺乏诉讼条件或者处罚条件，或者认为没有起诉的必要，从而不将犯罪嫌疑人诉交法院审判的处理决定。
酌定不起诉的法律依据是刑事诉讼法第173条第2款规定："对于情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或免除刑罚的，人民检察院可以作出不起诉决定。"
犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或免除刑罚的，主要包括犯罪嫌疑人又聋又哑，或者是盲人的;犯罪嫌疑人因防卫过当或紧急避险超过必要限度，并造成不应有危害而犯罪的;为犯罪准备工具制造条件的等。
我国刑事诉讼法第一百四十条规定，人民检察院审查案件，对于需要补充侦查的，可以退回公安机关补充侦查，也可以自行侦查。
对于补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，可以作出不起诉的决定。
这就意味着对公安机关或检察院侦查部门移送起诉的案件，检察机关经过审查认为证据不足，不符合起诉条件，拟作出不起诉决定前，必须退回公安机关或检察院侦查部门补充侦查。只有将案件退回补充侦查后，仍认为证据不足，不符合起诉条件，经院检察委员会讨论决定，才能作出不起诉决定。笔者认为，作出存疑不起诉决定前设置退回补充侦查的前置程序不妥。
如果发生了存疑不起诉的现象这几个时候是否补充侦查要看检察院有没有指示公安机关去执行。其次就是对于已经补充侦查的案件如果检察院依旧是认为证据不足的那么此时时不符合起诉的条件的，此时时可以做出不进行起诉的决定。
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