一、司法机关对于强奸罪应该如何认定?
1、嫌疑人侵犯了妇女的性自由。
2、表现为以暴力、胁迫或其他使妇女不能抗拒、不敢抗拒的手段，违背妇女意志，强行与妇女发生性关系的行为。
3、嫌疑人是年满十四周岁的男子。
4、嫌疑人是直接故意，并且具有强行奸淫的目的。
二、强奸案件中辩护人的权利有哪些?
1、在侦查阶段，受委托的律师可以会见在押的犯罪嫌疑人，为犯罪嫌疑人提供法律帮助，向犯罪嫌疑人了解有关的案件情况，向侦查机关了解犯罪嫌疑人涉嫌的罪名。
2、有要求公安机关对被起诉人解除或者变更强制措施的权利。
3、辩护律师自案件审查起诉之日起，可以查阅、摘抄、复制本案的诉讼文书，技术性鉴定材料;自人民法院受理案件之日起，可以查阅，摘抄，复制本案指控的犯罪材料。其他辩护人经人民检察院或者人民法庭许可，也可以拥有上述的权利。
4、辩护律师经证人或者其他有关单位和个人的同意，可以向他们收集与本案有关的材料。
5、辩护律师可以申请人民法院、人民检察院收集、调查证据，或者申请人民法院通知证人出庭作证。
6、人民法院决定开庭审判后，应当最迟在开庭3日以前向辩护人送达通知书。
7、发表意见权。
8、在法庭审理中，辩护人经审判长许可，可以对证人、鉴定人发问。
9、辩护人有权向法庭出示物证，当庭宣读可以作为证据的文书。
10、法庭审理中经审判长许可，辩护人可与公诉人，被害人等相互辩论。
11、代理申诉权。
12、辩护人经被告人同意，可以对第一审未生效的判决提出上诉。
13、拒绝辩护权。
其实对强奸罪进行认定的过程当中，很多时候双方各执一词的还是在发生性关系的时候，彼此的态度上，被告人之所以不认罪，是因为，认为当时对方是自愿和自己发生性关系的，而是否属于自愿发生性关系，这就需要通过相关的证据来证明了。
延伸阅读：
强奸罪私下赔偿有哪些
强奸罪报案时间最好是多久？
