1、两者发生的基础不同。行政赔偿由国家机关及其工作人员的违法行为引起，以违法为前提;国家补偿由国家的合法行为引起，不以违法为前提。
2、两者性质不同。国家补偿的根本属性在于国家对特定受害的公民法人或者其他组织损失的填补，旨在求得因公共利益而遭受特别损失的公民、法人或者其他组织提供补救，以体现其与普通公众间的利益平衡，并不意味着任何对国家的非难。这可以说是两者最主要的区别。
3、时间要求不同。行政赔偿责任的前提条件是损害的实际发生，即先有损害，后有赔偿;而国家补偿即可以在损害发生之前进行，也可以在损害发生之后进行。
4、两者承担责任的方式不同。行政赔偿责任以金钱赔偿为原则，以恢复原状，返还财产等方式为辅;国家补偿责任多为支付一定数额的金钱。
5、工作人员的责任不同。行政赔偿制度中有追偿制度。在国家赔偿了受害人的损失以后要向有故意或重大过失的作出违法行为的国家机关工作人员追偿，但是国家补偿制度中没有追偿制度。
申请书必须载明以下内容：
1、受害人的姓名、性别、年龄、工作单位和住所，如果是受害人的法定继承人或与其有抚养关系的亲属或法定代理人行使或代为行使请求权时，还应载明自己的姓名、性别、年龄、工作单位、住所以及与受害人的关系等事项;如果请求人是法人或其他组织时，则申请书应当载明其名称、住所、法定代表人或主要负责人的姓名和职务。受害的法人或其他组织终止的，承受其权利的法人或其他组织提起行政赔偿诉讼的，则应提交原法人或组织终止的证明材料，以及赔偿请求人与终止的法人或其他组织之间的关系的证明材料。
2、具体的赔偿请求。例如，是要求金钱赔偿，还是返还财产等，提出的赔偿请求有多项的，应分项写清楚。
3、要求行政赔偿的理由和事实根据。主要是写明行政损害行为发生的地点、时间、事实经过、造成损害程度及证明材料。如对人身造成伤害的，应提交受害人死亡证明，说明死亡原因、时间、地点等证明材料以及死者生前职业、工资、收入状况、生前抚养人的基本情况、丧葬费开支等证明材料。
总之，行政赔偿和国家补偿完全是两回事，简单的进行区分的话，行政赔偿是行政单位的，这些工作人员在行使职权的过程当中违反了相关法律规定，国家补偿的话，最常见的就是征地补偿属于典型的国家补偿。
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