(1)起诉。行政诉讼实写"不告不来"原则，即当事人不起诉，人民法院不能主动受理。
(2)受理。人民法院经审查认为符合起诉条件的，应当在7日内立案受理。经审查不符合起诉条件的，在法定期限内裁定不予受理。人民法院经过审查受理后，进入一审程序。此时，人民法院指定审判员组成合议庭，或者由审判员、陪审员组成合议庭。当事人认为审判人员与本案有利害关系或者有其他关系，可能影响公正审判的，有权申请审判人员回避。人民法院审理行政案件，以法律和行政法规、地方性法规为依据(地方性法规适用于本行政区域内发生的行政案件)。审理民族自治地方的行政案件，并以该民族自治地方的自治条例和单行条例为依据。同时，参照国务院部、委根据法律和国务院的行政法规、决定、命令制定、发布的规章及省、自治区、直辖市和省、自治区的人民政府所在地的市和经国务院批准的较大的市的人民政府根据法律和国务院的行政法规制定、发布的规章。人民法院应当在立案之日起 3 个月内作出第一审判决。有特殊情况需延长的，由高级人民法院批准。高级人民法院审理第一审案件需延长的，由最高人民法院批准。
(3)审理。人民法院审理的主要内容是对具体行政行为的合法性进行审查。人民法院审理行政案件，不适用调解。
二、申请国家赔偿的时效
赔偿请求人请求国家赔偿的时效为两年，自国家机关及其工作人员行使职权时的行为被依法确认为违法之日起计算，但被羁押期间不计算在内。赔偿请求人在赔偿请求时效的最后六个月内，因不可抗力或者其他障碍不能行使请求权的，时效中止。从中止时效的原因消除之日起，赔偿请求时效期间继续计算。
赔偿义务机关应当自收到申请之日起两个月内给予赔偿;逾期不予赔偿或者赔偿请求人对赔偿数额有异议的，赔偿请求人可以自期间届满之日起三十日内向上一级机关申请复议。
复议机关应当自收到申请之日起两个月内作出决定。赔偿请求人不服复议决定的，可以在收到复议决定之日起三十日内向复议机关所在地的同级人民法院赔偿委员会申请作出赔偿决定;复议机关逾期不作决定的，赔偿请求人可以自期间届满之日起三十日内向复议机关所在地的同级人民法院赔偿委员会申请作出赔偿决定。
三、人民法院审查申请的时间限制
赔偿委员会收到赔偿申请后，应当在七日内决定是否立案。赔偿请求人补充有关证明材料的，赔偿申请的时间应当自材料补充齐全后起算。
经审查，认为赔偿请求人的赔偿申请依法不属于赔偿委员会受理的，应当告知赔偿请求人向有关机关提出赔偿申请，或者转请有关部门处理，并通知赔偿请求人。
赔偿请求人依法向赔偿委员会申请作出赔偿决定的被侵权事项，应当先经过依法确认。被要求确认的机关不予确认的，赔偿请求人有权申诉。赔偿委员会不受理要求确认的申诉案件。
既然赔偿义务机关已经明确拒绝国家赔偿的申请，当事人还要坚持申请国家赔偿的话只能是提起行政诉讼。而行政诉讼的流程其实和民事诉讼并没有多大的差别，问题的关键在于当行政机关和原告方持相反态度的情况下，如何证明行政机关确实有侵权行为，对原告方来说也不是那么容易的。
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