违法发放贷款罪中的贷款合同是无效的，因为这涉嫌以合法形式掩盖非法目的。
《民法典》（2021年1月1日起实施）
第一百四十三条 具备下列条件的民事法律行为有效：
(一)行为人具有相应的民事行为能力;
(二)意思表示真实;
(三)不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。
第一百四十四条 无民事行为能力人实施的民事法律行为无效。
第一百五十三条 违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效。但是，该强制性规定不导致该民事法律行为无效的除外。
违背公序良俗的民事法律行为无效。
第一百五十四条 行为人与相对人恶意串通，损害他人合法权益的民事法律行为无效。
第一百五十五条 无效的或者被撤销的民事法律行为自始没有法律约束力。
第一百五十六条 民事法律行为部分无效，不影响其他部分效力的，其他部分仍然有效。
银行或者其他金融机构的工作人员违反法律、行政法规规定，向关系人以外的其他人发放贷款，造成重大损失的，处5年以下有期徒刑或者拘役，并处1万元以上10万元以下罚金;造成特别重大损失的，处5年以上有期徒刑，并处2万元以上20万元以下罚金。
单位犯本罪的，对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依照上述规定处罚。
根据最高人民检察院、公安部《关于公安机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定(二)》第四十二条，银行或者其他金融机构及其工作人员违反国家规定发放贷款，涉嫌下列情形之一的，应予立案追诉:
虽然借款合同是无效的，但毕竟真实的发生了借款行为，所以当事人还是要依法还钱的。违法发放贷款案件当中所要追究的不仅仅是放贷人，故意提供虚假材料骗取贷款的这些人，根据自己的所作所为也是要被追责的，比如有些人甚至无知到私刻单位的公章借贷。
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