处三年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金;对人体健康造成严重危害或者有其他严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金;致人死亡或者有其他特别严重情节的，处十年以上有期徒刑、无期徒刑或者死刑，并处罚金或者没收财产。
在认定这类案件性质时，要注意区分生产、销售劣药罪与生产、销售假药罪的界限，关键在于两点：一是犯罪对象不同，一为假药，一为劣药;二是犯罪形态不同，生产、销售劣药罪是实害犯，生产、销售假药罪是危险犯。
1、本罪与过失销售劣药的界限
由于劣药在市场中大量存在，以及销售主体的多元化，所以因为缺乏药品专业知识和疏忽大意而造成的过失销售劣药的情况也相当普遍，但销售劣药罪只能由故意构成，所以，过失销售劣药即使造成了严危害结果，也不构成犯罪。
2、本罪与生产、销售伪劣产品罪的界限
本罪的犯罪对象与生产、销售伪劣产品罪的犯罪对象存在从属关系，因而易于混淆。但两罪在犯罪客体、犯罪对象以及认定标准上存在着明显的差别。生产、销售劣药，如果对人体健康未造成严重危害的，不构成生产、销售劣药罪，但如其销售金额在5万元以上，根据刑法第149的规定，应构成生产、销售伪劣产品罪。如果生产、销售劣药，既对人体健康造成严重危害，其销售金额又在5万元以上，对此情况，应按照刑法第149条第2款的原则处理，即依照处刑较重的规定定罪处罚。
3、本罪与诈骗罪的界限
二者除犯罪主体不同外，在客观方面也有所不同。生产、销售劣药罪在客观上有生产、销售行为;而诈骗罪的行为人利用欺骗的手段，把根本不具有药品效能的物品当作药品诈骗钱财，甚至不考虑其外观和包装。
两罪的区别在于：第一，犯罪对象不同。前者犯罪对象是劣药;后者犯罪对象是假药。第二，犯罪的客观方面的认定标准不同。生产、销售假药罪只要有“足以危害人体健康”的危险状态就能成立;生产、销售劣药罪则须对人体健康造成严重危害才能成立。
生产销售假药和生产销售劣药有区别。假药的危害性通常来说比劣药的危害性更大，因为生产，销售假药可能是生产商用非药品来冒充药品，而劣药他可能在功效没有达到那么完备。因此，生产销售假药根据他的犯罪结果以及造成的危害，通常情况下会判除3~10年的有期徒刑。
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