法律上对为亲友非法牟利罪的量刑作出了明确的规定。如果国有企业、公司或事业单位的工作人员，利用职务便利，为亲友进行非法牟利，导致国家利益遭受重大损失的。那么法院不仅会判处该犯罪嫌疑人三年以下有期徒刑，或者拘役，还会判处或者单处罚金。如果犯罪嫌疑人导致国家利益遭受特别重大损失的，那么法院不仅会判处三年以上七年以下的有期徒刑，还会处罚金。
正确区分本罪与一般背信经营行为的界限，主要应从三个方面考察：
第一，看行为人是否利用了职务便利。如果行为人没有利用职务便利，即使对其亲友所进行的经营活动提供了帮助，也不能以本罪论处。
第二，看行为人通过实施背信经营行为而使国家利益遭受的损失是否达到重大，如果行为人的背信经营行为未使国家利益遭受的损失达到重大的程度，就不能以本罪论处。数额是否巨大不是构成本罪的必要要件，因为本条中并无行为人非法获利及其数额大小的规定，而只有行为人利用职务便利，实施背信经营行为，使国家利益遭受重大损失或特别重大损失的规定，因此，划分本罪与非罪的界限，其标准之一，应为行为人实施背信经营行为而使国家利益遭受的损失是否达到重大或特别重大。
在这里，国家利益遭受的重大损失与行为人非法获利数额巨大或数额单位采取高价采购或低价销售商品甚至采购自己亲友经营管理单位的不合格商品，从而将亲友经营的损失转嫁给单位，造成的损失数额巨大，显然是不同的犯罪结果，不应混为一谈。
第三，背信经营罪的犯罪主体为特殊主体，即国有公司、企业、事业单位工作人员，除此以外人员的背信经营行为不构成本罪，对于他们的背信经营行为只能追究其民事责任和行政责任。如果构成侵占或者其他犯罪的，应以相关犯罪论处。
国有公司、企业、事业单位的工作人员，利用职务便利，有下列情形之一，使国家利益遭受重大损失的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金;致使国家利益遭受特别重大损失的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金：
(一)将本单位的盈利业务交由自己的亲友进行经营的;
(二)以明显高于市场的价格向自己的亲友经营管理的单位采购商品或者以明显低于市场的价格向自己的亲友经营管理的单位销售商品的;
(三)向自己的亲友经营管理的单位采购不合格商品的。
事业单位的员工为亲友谋取利益，达到一定数额构成为亲友非法牟利罪，该罪有两种处罚方式，一种是判处三年以下有期徒刑，一种是判处3~7年有期徒刑，具体适用哪种刑罚，要根据实际状况来确定。造成国家利益重大受损的适用于第一种，造成国家利益特别重大损失的适用第二种。
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