一、妨害传染病防治罪立案标准是怎样的
根据《最高人民检察院、公安部关于公安机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定(一)》第49条的规定，违反传染病防治法的规定，引起甲类或者按照甲类经管的传染病传播或者有传播严重危险，涉嫌下列情形之一的，应予立案追诉：
(一) 供水单元供应的饮用水不符合国家规定的卫生标准的;
(二)拒绝按照疾病预防控制机构提出的卫生要求，对传染病病原体污染的污水、污物、粪便进行消毒处理的;
(三)准许或者纵容传染病病人、病原携带者和疑似传染病病人从事国务院卫生行政部门规定禁止从事的易使该传染病扩散的工作的;
(四)拒绝执行疾病预防控制机构遵照传染病防治法提出的预防、控制措施的。
二、妨害传染病防治罪构成要件有哪些?
妨害传染病防治罪，是指违反传染病防治法规定，引起甲类传染病传播或者有传播严重危险的行为。
(一)主体
本罪的主体是一般主体，根据司法实践，一般是指供水单位及有关机关、企事业单位、人民团体等单位的直接责任人员，只有他们才能直接涉及到供水、对病原体污染物的消毒处理等各项极易使传染病传播的具体工作。
(二)主观方面
本罪在主观方面表现为过失，即行为人对引起甲类传染病传播或传播严重危险这一结果是不明知的。但行为人违反传染病防治法规定的行为则是故意的。如果行为人明知会引起甲类传染病传播或传播严重危险而仍实施违反传染病防治法规定的行为的，则不能以本罪论处，而应以危害公共安全罪论处。
(三)客体
本罪侵害的客体是国家关于传染病防治的管理制度。传染病是由各种病原体引起的，能在人与人、动物与动物或人与动物之间相互传播的一类疾病。《传染病防治法》规定管理的传染病有甲、乙、丙三类共39种，其中甲类传染病是指：鼠疫、霍乱。
(四)客观方面
本罪在客观方面表现为违反国家传染病防治法规定，引起甲类传染病传播或者有传播严重危险的行为。本罪在具体行为方式上表现为下述四种情形：
1、供水单位供应的饮用水不符合国家规定的卫生标准的;
2、拒绝按照卫生防疫机构提出的卫生要求，对传染病病原体污染的污水、污物、粪便进行消毒处理的;
3、准许或者纵容传染病病人、病原携带者和疑似传染病病人从事国务院卫生行政部门规定禁止从事的易使该传染病扩散的工作的;
4、拒绝执行卫生防疫机构依照传染病防治法提出的预防、控制措施的。
本罪属危险犯，必须以发生法定的危害危险，即引起甲类传染病传播或者有传播严重危险的为必备构成要件。甲类传染病，就目前而言，包括鼠疫和霍乱两种。
传染病防治是涉及公众健康的大事，也就是涉及到每一个公民、每一个社会组织，需要所有的公民参与。当前，新型冠状病毒感染的肺炎纳入《中华人民共和国传染病防治法》规定的乙类传染病，并采取甲类传染病的预防、控制措施，对于相关引起新型冠状病毒传播或者有传播严重危险的行为，可以直接适用妨害传染病防治罪。
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