人民法院对自诉案件，可以进行调解;自诉人在宣告判决以前，可以同被告人自行和解或者撤回起诉。通过法院调解，自诉人同被告人和解或者自诉人与被告人自行和解或者自诉人撤回起诉的，法院就不再追究被告人的刑事责任。
自诉案件有其自身特点，一般是很轻微的刑事案件，允许自诉人撤回起诉，可以减少争讼，有利于社会、家庭的稳定。
对于被害人有证据证明对被告人侵犯自己人身、财产权利的行为应当依法追究刑事责任，而公安机关或者人民检察院不追究被告人刑事责任的自诉案件，人民法院不能进行调解，应当依法予以处理。因为这类自诉案件是公安机关、检察机关没有履行职责，该管不管的案件，而且其中有些案件从性质上说应当是公诉案件，只是因为公安机关、检察机关不履行自己的职责，为了解决老百姓告状无门的问题，惩罚犯罪，才由法律规定被害人可以直接控诉到人民法院，所以人民法院在审理这类自诉案件时，不能适用调解。如果其中有属于告诉才处理的案件或者是轻微的刑事案件，可以允许自诉人和被告人自行和解或者自诉人撤回自诉。
人民法院直接受理的自诉案件包括：
(一)告诉才处理的案件：
1.侮辱、诽谤案(刑法第二百四十六条规定的，但严重危害社会秩序和国家利益的除外);
2.暴力干涉婚姻自由案;
3.虐待案;
4.侵占案。
(二)人民检察院没有提起公诉，被害人有证据证明的轻微刑事案件：
1.故意伤害案;
2.非法侵入住宅案;
3.侵犯通信自由案;
4.重婚案;
5.遗弃案;
6.生产、销售伪劣商品案(刑法分则第三章第一节 规定的，但严重危害社会秩序和国家利益的除外);
7.侵犯知识产权案(刑法分则第三章第七节 规定的，但严重危害社会秩序和国家利益的除外);
8.刑法分则第四章、第五章规定的，对被告人可能判处三年有期徒刑以下刑罚的案件。
本项规定的案件，被害人直接向人民法院起诉的，人民法院应当依法受理。对其中证据不足、可以由公安机关受理的，或者认为对被告人可能判处三年有期徒刑以上刑罚的，应当告知被害人向公安机关报案，或者移送公安机关立案侦查。
(三)被害人有证据证明对被告人侵犯自己人身、财产权利的行为应当依法追究刑事责任，且有证据证明曾经提出控告，而公安机关或者人民检察院不予追究被告人刑事责任的案件。
如果是刑事自诉案件的双方当事人协商一致，达成和解的，此时是需要签署相应的和解协议的，但是双方当事人的和解协议的内容，必须是符合法律规定的，如果是当事人自行达成的和解协议之后，一方不履行协议，对方可另行起诉。
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