申请技术合同认定收费千分之三是不合理吗，国家是免收认定的登记费；
技术合同认定登记是指根据《技术合同认定登记管理办法》设立的技术合同登记机构对技术合同当事人申请认定登记的技术合同文本从技术上进行核查，确认其是否符合技术合同要求的专项管理工作。法人、个人和其他组织依法订立的技术开发合同、技术转让合同、技术咨询合同和技术服务合同都属于认定登记的范围。
1、已经生效的技术合同原件、复印件各一份(盖骑缝章)，原件封底贴上印花税。
2、经费支出预算清单一式两份，加盖公司公章和财务专用章。
(备注：年度内首次办理需提交企业营业执照副本复印件一份，软件企业除提交企业营业执照副本外还需提供软件企业认定证书复印件;合同不是本企业法定代表人签定的，需要提供企业法定代表人出具的委托授权书。)
1、经认定登记的技术合同，当事人可以依照有关规定享受国家有关促进科技成果转化的税收信贷和奖励等方面的优惠政策，而未申请认定登记和未予登记的合同不得享受有关优惠政策。优惠政策主要包括：企业支付的技术价款、报酬、使用费或者佣金可以按照国家有关规定摊入成本;对从事技术转让，技术开发业务和与之相关的技术咨询，技术服务取得的收入，免征营业税和所得税等。
2、技术合同登记机构可以通过认定登记帮助当事人完善合同，从而提高合同的履约率，减少技术合同的纠纷。
3、从事技术开发、技术转让、技术服务、技术咨询的企业，可在纯收入中提取20%至30%作为当事人的津贴和奖励，奖励金额均不计入单位奖金总额。另外，技术合同登记数量和金额是科技项目参与评奖的重要参考指标。
4、技术合同登记数量和交易额可作为企业(或个人)的资信凭证之一，可以帮助企业(或个人)更顺利的在银行获得贷款，提高企业(或个人)在银行的信誉度。
5、经认定登记的技术合同交易额是高新技术企业资格年审复核和企业所得税减免的重要考核依据。
6、技术市场的管理部门可以通过技术合同的认定登记，加强对技术市场和科技成果转化工作的宏观指导，管理和服务，并进行相关的技术市场的统计和分析工作。
综合上面所说的，技术合同一般在生效了之后是需要进行认定登记的，只有获得国家的认可，那么才可以享受到相关的优惠政策，而且此认定国家是属于免费的认定，其目的性就是为了更好的发展技术创新，发展高科技，而且在认定之后还可以得到一定比例的奖励。
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