技术合同跨地市认定规定是双方当事人是可以通过诉讼或者是双方当事人协商方式来进行认定，《最高人民法院关于审理技术合同纠纷案件适用法律若干问题的解释》
各高级人民法院根据本辖区的实际情况并报经最高人民法院批准，可以指定若干基层人民法院管辖第一审技术合同纠纷案件。
合同中既有技术合同内容，又有其他合同内容，当事人就技术合同内容和其他合同内容均发生争议的，由具有技术合同纠纷案件管辖权的人民法院受理。
技术合同必须备案，签订技术合同的双方当事人都是需要备案的。具体流程是：
(一) 卖方用户注册
买方凭真实、有效证件到登记机构注册或自行注册。首次申请认定登记的卖方，需在广东省科技业务综合管理系统注册、上传法人证书、营业执照、企业信息表并选择技术合同认定登记点进行申报。
(二) 网上申报登记
卖方根据技术合同内容，在“广东省科技业务综合管理系统”技术合同登记业务系统，凭用户名和密码登录后填“登记申请书”并提交，也可以有选择的技术合同认定登记机构进行登记。
(三) 报送合同文本
卖方按申报材料要求，将技术合同和其他附件材料报送选定的技术合同登记机构审核。注:设计专利技术合同的，直接向国家知识产权局专利局广州代表处申请认定登记。
(四) 审核登记
登记员查阅卖方网上“登记申请书”并根据卖方送审合同文本材料进行审核、认定登记、盖章，出具认定登记证明。(由市级登记机构初审核盖章，并送审计科技部门审核盖章)
(五) 卖方办理减免税
卖方凭核定后的技术合同认定登记证明，到企业所在税务部门办理免税或退税手续(保税办理程序见手册)
(一)符合技术开发(委托开发、合作开发)合同，技术转让(专利申请权、专利权、专利实施许可、技术秘密)合同，可享受技术交易额免征5%营业税。
(二)符合技术转让所得免征、减征企业所得税;在一个纳税年度内不超过500万元的部分，免征企业所得税;超过500万元的部分减半征收企业所得税。
(三)与技术转让、技术开发相关的技术咨询，技术服务业务，转让方根据技术开发合同的规定，为帮助受托方(委托方)掌握所转让(或委托开发)的技术而提供技术咨询、技术服务，切这部分技术咨询、技术服务的价款与技术转让(或开发)的价款是开在同一张发票上的，可享受免征5%营业税。
(一) 卖方主体证明材料:法人证书(副本)或本人身份证(外籍人士可用护照)。
(二) 生效合同的正本文本及全部附件，(原件和复印件各一式一份)签字盖章完整有效，字迹清楚。使用科技部印制的示范合同文本，贴好印花税。
(三) 财务预算清单(费用清单)核定技术收入。
(四) 涉外合同登记提供合同的文本(外文合同需翻译成中文并于外文原文合同同时附上)、外经贸部门技术进口合同登记证书、技术进口合同数据表、委托书、双方营业执照(复印件)。
1、合同原件、复印件各一份;
2、合同登记申请书、信息表;
3、委托经办人授权书原件;
4、经办人身份证复印件;
5、合同金额发票复印件;
6、相关证明。
在我们的日常生活当中，现在大家对于技术方面的合同并不是特别的了解，技术合同一般情况下是需要登记备案的，同时需要提醒大家注意，如果涉及到技术合同认定的问题的话，那么必须要予以明确，否则的话很容易发生纠纷的。
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