委托代理与行纪合同都是基于双方当事人的彼此信任而产生，由一方代为另一方办理委托的事务，其法律后果由委托方承受。但是，这两种合同又有所区别：
其一，行纪合同必须是有偿的，委托人要向行纪人支付报酬;而委托合同可以是有偿的，也可以是无偿的。
其二，行纪合同的主体具有限定性。在我国，行纪合同的委托人可以为公民或法人，但行纪人只能是经批准经营信托业务的法人，未经法定手续批准经营信托业务的法人或公民不得经营信托业务，不能成为行纪合同中的行纪人。而委托合同的适用范围十分广泛，各类民事主体之间均可建立委托合同关系，对委托人、受托人没有什么特殊的要求。
其三，行纪合同中的行纪人是以自己的名义办理行纪事务，委托人不直接与第三人发生法律上的权利义务关系;而委托代理合同中的受托人可以以委托人的名义办理委托事务，也可以以自己的名义办理委托事务。在前一种情况下，委托人直接与第三人之间产生权利义务关系。
二、行政合同的特点
大部分学者认为行纪合同是独立有名合同，因为行纪合同有自己独特的特点。为此，许多国家和地区的民法都设专章予以规定，认其为独立有名合同。我国合同法也对行纪合同设专章予以规定，把它确定为独立有名合同。
第二，行纪人以自己的名义为委托人办理所受委托的事务
行纪合同履行时，行纪人以自己的名义办理行纪事务，如代购、代销、寄售等。行纪人与第三人之间的权利义务由行纪人自己享有或承担。委托人与第三人之间不存在直接的权利义务关系，委托人也不对行纪人的行为承担责任。这是行纪合同和委托合同的主要区别。
第三，行纪人在与第三人实施行为时应考虑委托人的利益
行纪合同的行纪人在办理行纪业务时，虽然是与第三人直接发生法律关系，但其因该关系所产生的权利和义务最终应归属于委托人，因此行纪人在与第三人实施行为时，应考虑委托人的利益，并将其结果归属于委托人。
第四，标的是行为
行纪合同是行纪人为委托人提供的与第三人实施的法律行为的服务。行纪人与第三人进行的法律行为才是订立行纪合同的目的，是行纪合同的标的，所以行纪合同的标的是行为。
行纪人负有为委托人办理买卖或其他商事交易的义务，而委托人负有给付报酬的义务。双方的权利和义务是对应的;同时，行纪人完成事务须收取报酬，即为有偿性的服务，所以行纪合同是双务有偿合同。行纪合同是需双方当事人之间的意思表示一致即告成立，合同无需采用特定的形式，所以行纪合同是诺成合同，不要式合同。
行纪合同和委托代理的区别有第一行纪合同一定是有偿的，而委托代理合同可以有偿也可以无偿。第二行纪合同的主体是有限制的，而委托合同只要是合法的主体即可。第三行纪合同和委托代理合同的具体内涵也不同。
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