先建账，再做账。科目应该根据企业性质设置不同的账目。共行为：
(一)选择适用准则。应根据企业经营行业、规模及内部财务核算特点，选择适用《企业会计准则》或《小企业会计准则》。
《小企业会计准则》适用于在中华人民共和国境内设立的、同时满足下列三个条件的企业(即小企业)：
1.不承担社会公众责任;
2.经营规模较小;
3.既不是企业集团内的母公司也不是子公司。
如果不能同时满足上述三个条件，企业需要选择《企业会计准则》。
按规定需要建账的个体工商户参照执行《小企业会计准则》。
(二)准备账簿
1.建账时应考虑的问题
(1)与企业相适应。企业规模与业务量是成正比的，规模大的企业，业务量大，分工也复杂，会计账簿需要的册数也多。企业规模小，业务量也小，有的企业，一个会计可以处理所有经济业务，设置账簿时就没有必要设许多账，所有的明细账可以合成一、两本就可以了。
(2)依据企业管理需要。建立账簿是为了满足企业管理需要，为管理提供有用的会计信息，所以在建账时以满足管理需要为前提，避免重复设账、记账。
(3)依据账务处理程序。企业业务量大小不同，所采用的账务处理程序也不同。企业一旦选择了账务处理程序，也就选择了账簿的设置，如果企业采用的是记账凭证账务处理程序，企业的总账就要根据记账凭证序时登记，自己就要准备一本序时登记的总账。
2.小企业应设置的账簿
(1)现金日记账，一般企业只设1本现金日记账。但如有外币，则应就不同的币种分设现金日记账。
(2)银行存款日记账，一般应根据每个银行账号单独设立1本账。如企业只设了基本账户，则设1本银行存款日记账。
现金日记账和银行存款日记账均应使用订本账。根据单位业务量大小可以选择购买100页的或200页的。
(3)总分类账，一般企业只设1本总分类账。外形使用订本账，根据单位业务量大小可以选择购买100页的或200页的。这1本总分类账包含企业所设置的全部账户的总括信息。
(4)明细分类账，明细分类账采用活页形式。存货类的明细账要用数量金额式的账页;收入、费用、成本类的明细账要用多栏式的账页;应交增值税的明细账单有账页;其他的基本全用三栏式账页。因此，企业需要分别购买这4种账页，数量的多少依然是根据单位业务量等情况而不同。业务简单且很少的企业可以把所有的明细账户设在1本明细账上;业务多的企业可根据需要分别就资产、权益、损益类分3本明细账;也可单独就存货、往来账项各设1本，对于此处没有硬性规定，完全视企业管理需要来设。
(三)科目选择。可参照选定会计准则中会计科目及主要账务处理，结合自己单位所属行业及企业管理需要，依次从资产类、负债类、所有者权益类、成本类、损益类中选择出应设置的会计科目。
(四)填制账簿内容
1.封皮
2.扉页(或使用登记表，明细账中称经管人员一览表)：
(1)单位或使用者名称，即会计主体名称，与公章内容一致;
(2)印鉴，即单位公章;
(3)使用账簿页数，在本年度结束(12月31日)据实填写;
(4)经管人员，需盖相关人员个人名章。记账人员更换时，应在交接记录中填写交接人员姓名、经管及交出时间和监交人员职务、姓名;
(5)粘贴印花税票并划双横线，除实收资本、资本公积按万分之五贴花外，其他账簿均按5元每本贴花。如明细账分若干本的话，还需在表中填列账簿名称。
3.总分类账的账户。采用订本式，印刷时已事先在每页的左上角或右上角印好页码。但由于所有账户均须在一本总账上体现，故应给每个账户预先留好页码。如“库存现金”用第1、2页，“银行存款”用第3、4、5、6页，根据单位具体情况设置。并要把科目名称及其页次填在账户目录中。
明细分类账由于采用活页式账页，在年底归档前可以增减账页，故不用非常严格的预留账页。
现金或银行存款日记账各自登记在一本上，故不存在预留账页的情况。
4.账页
(1)现金和银行存款日记账不用对账页特别设置;
(2)总账账页按资产、负债、所有者权益、成本、收入、费用的顺序把所需会计科目名称写在左上角或右上角的横线上，或直接加盖科目章。
(3)明细账账页按资产、负债、所有者权益、成本、收入、费用的顺序把所需会计科目名称写在左(右)上角或中间的横线上，或直接加盖科目章，包括根据企业具体情况分别设置的明细科目名称。另外对于成本、收入、费用类明细账还需以多栏式分项目列示，如“管理费用”借方要分成：办公费、交通费、电话费、水电费、工资等项列示，具体的是按企业管理需要，即费用的分项目列示，每个企业可以不相同。
为了查找、登记方便，在设置明细账账页时，每一账户的第一张账页外侧粘贴口取纸，并各个账户错开粘贴。
综合上面所说的，个人独资企业也要是需要按规定进行财务做账，一般在进行处理时就需要按法律所做账的流程来进行办理，而且不同的费用所涉及到的科目就会不一样，如果不清楚，那么是可以请专业的会计进行处理，这样也才能保障到自己的利益。
延伸阅读：
个人独资企业变更投资人后的债务如何承担
个人独资企业怎样变更法人代表
个人独资企业注册资金是多少？
