如果是两个单位合并，a单位帐合并到b单位帐，a单位帐面应收、应付款直接并入b单位帐中，合并以后即作为b单位应收、应付款处理即可。如果原来两个单位互有往来帐项，在合并时先对冲。年终结账时，对已完工的项目，“拨入专款”与“拨出专款”、和“专款支出”对冲，工程项目未完工前，账户余额结转下年。
《公司法》第173条：“公司合并可以采取吸收合并或者新设合并。一个公司吸收其他公司为吸收手柄，被吸收的公司解散。两个以上公司合并设立一个新的公司为新设合并，合并各方解散”。
延伸阅读：
辞退员工补助怎么做帐？
合同违约金处罚怎么做帐？
劳动合同经济补偿金做帐怎么做？
