商标权著作权冲突是指著作权和商标权都具有合法性，在对两者未进行协调或者处理的情况下，两者之间可能出现的对抗。对于这样的权利冲突，解决的基本原则是“权利在先”原则，即对在先的权利给予保护，而在后的权利可能被认定侵犯在先权利。《商标法》第31条规定的“申请商标注册不得损害他人现有的在先权利，也不得以不正当手段抢先注册他人已经使用并有一定影响的商标”，此处的“在先权利”，即包括了在先成立、生效的著作权。商标权与著作权是两种不同的知识产权，分别由《商标法》和《著作权法》予以保护。
(1)保护的目的不同
著作权保护的是在文学，艺术和科学方面所创作的作品和与此相关的权益。其目的在于鼓励有益于社会的作品创作和传播，促进社会文化和科学事业的发展和繁荣。
商标权保护的商标，是具有区别商品或服务来源的显著特征的标志。保护的目的是为了促进生产者保证商品质量和维护商标信誉，以保障消费者的利益，促进社会商品经济的发展和公平竞争。
(2)国家主管机关和适用法律不同
我国《著作权法》是管理著作权的基本法律。国家版权局是主管全国著作权的管理工作。
我国《商标法》是管理商标的基本法律。国家工商行政管理局商标局是主管全国商标注册和管理的工作。
(3)时效性不同
我国《著作权法》规定，作者的署名权，修改权，保护作品完整权的保护期不受限制。公民作品的发表权，使用权和获得报酬权的保护期为作者终生及其死亡后50年;如果是合作者作品，截止于最后死亡的作者死亡后50年。
法人或非法人单位的作品，著作权(署名权除外)由法人或非法人单位享有的职务作品，其发表权，使用权和获得报酬权的保护期为50年。电影，电视，录像和摄影作品的发表权，使用权和获得报酬权的保护期为50年。作品自创立完成后50年内未发表的不再保护。
而我国《商标法》规定，注册商标的有效期为10年，期满可以续展注册，而且可以无制重复申请，每次续展注册的有效期均为10年。
在司法实践中，商标权与著作权是存在一定的区别的，特别是两者的法律适用，以及权利的类型和认定情况都是不同的，涉及到两者存在冲突的情况下，应当看首先适用的权利是什么，而对于后来适用的权利可以认定为侵权行为。
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