恶意申请的专利权是无效的，根据《中华人民共和国专利法实施细则》第六十四条的规定，专利权“无效宣告请求的理由”即导致专利权无效的“情形”，包括以下几个方面：
1、主题不符合专利授予条件，包括：发明、实用新型的主题不具备新颖性、创造性或实用性;外观设计专利的主题不具备新颖性或者与他人在先取得的合法权利相冲突。
2、专利申请中的不合法情形：说明书没有充分公开发明或者实用新型;授权专利的权利要求书没有以说明书为依据;专利申请文件的修改超出规定的范围;专利权的主题不符合发明、实用新型或外观设计的定义;同时申请的协商授权原则;授权专利的权利要求书不清楚、不简明或者缺少解决其技术问题的必要技术特征;
3、违反法律强制性规定的情形，包括：违反国家法律、社会公德或者妨害公共利益的情形;科学发现等法律规定不授予专利权的情形;
4、重复授权的情形：两个以上的申请人分别就同样的发明创造申请专利的，专利权授予最先申请的人，即一个发明创造只向一个人(最先申请的人)授予专利权。发明、实用新型和外观设计出现上述情形不能取得专利权，已经取得专利权的，可以宣告其无效。
第一是科学发现;
第二是智力活动的规则和方法;
第三是疾病的诊断和治疗方法;
第四是动物和植物品种;
第五是用原子核变换方法获得的物质;
第六是对平面印刷品的图案、色彩或者二者的结合所作的主要起标识作用的设计。
对动物和植物品种产品的生产方法，是可以依照法律的规定授予专利权的。
此外，专利法还规定：对违反法律、社会公德或者妨害公共利益的发明创造，不授予专利权。对于违反法律、行政法规的规定获取或者利用遗传资源，并依赖该遗传资源完成的发明创造，不授予专利权。
另外，专利法还规定：任何单位或者个人将在中国完成的发明或者实用新型向外国申请专利的，应当事先报国务院专利行政部门进行保密审查。对违反规定向外国申请专利的发明或者实用新型，在中国申请专利的，是不授予专利权的。
恶意申请专利权的这种做法，实际上就是当事人恶意抢先申请别人创作出来的发明物，在已经被授予了专利权的情况下，如果原发明人认定对方是恶意申请专利权的，还得先向国家知识产权总局提交相关的证明材料，专利权无效必须要由国家知识产权总局依法宣告。
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