1.拒绝出具离职证明
依据我国《劳动合同法》的规定，员工未履行提前通知义务时，用人单位有权拒绝为其出具解除劳动合同的证明，可以在一定程度上预防员工不履行交接手续。
2.造成损失的，要求员工赔偿
员工未履行工作交接手续，而给用人单位造成经济锚点损失的，用人单位可以要求员工赔偿。但要注意，实践中用人单位需有证据证明存在经济损失，且经济损失与员工未履行交接手续间存在直接的因果关系。如员工恶意将公司某些重要文件、密码等物品及信息带走，造成公司业务停滞或遭受其它直接损失的，公司可以要求员工赔偿。
3.紧急情况下可以扣发工资
无论在何种情况下扣发工资在法律上都存在风险。但是，如果员工将公司的重要财物，如汽车、笔记本电脑、手机或其他重要信息带走拒不归还或拒不告知公司的，可能会给公司造成无法弥补的经济损失，那么公司可以适当扣发其工资。司法实践中，对于公司扣发工资的行为，往往是有权机关要求公司予以纠正，只有在公司拒不改正的情况下，才会处以罚则。
4.注意事项
如果双方约定了办理工作交接的时间，劳动者没有按照约定办理，此时，用人单位自然可以对抗劳动者支付经济补偿金的请求。用人单位应当用规章制度来规范劳动者的离职手续，应该在劳动合同中写明员工离职时应该严格按照公司的规章制度办理离职手续，并在规章制度中对此进行具体、详细的规定。并且，用人单位应在规章制度中明确规定劳动者拒不配合用人单位进行工作交接的，属于严重违反规章制度的行为。
《劳动合同法》第五十条第二款的规定，劳动者应当按照双方约定，办理工作交接。用人单位依照本法有关规定向劳动者支付经济补偿的，在办结工作交接时支付。
《劳动合同法》第三十九条明确规定，如果劳动者严重违反规章制度的，用人单位可以解除劳动合同，并且不用支付经济补偿金。
综上所述，如果员工没有及时进行工作交接，那么根据相关法律的规定，用人单位只是可以暂时不用支付其经济补偿金，如果员工交接完工作了，还是需要进行支付的。
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