1、公民(自然人)违法主体认定
公民(自然人)主体认定，一般应以身份证为准。
2、依法认定(有字号的)个体工商户违法主体
最高人民法院《关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉若干问题的意见》第46条规定：在诉讼中，个体工商户以营业执照上登记的业主为当事人。有字号的，应在法律文书中注明登记的字号
3、事业单位未经核准登记的无照经营行为以事业单位为违法主体予以认定
4、其他组织的无照经营行为以其他组织为违法当事人予以认定。
5、个人或合伙以公司名义从事无照经营活动的，以直接责任人为当事人予以认定。
二、相关法律规定
《中华人民共和国环境保护法》第五十九条
企业事业单位和其他生产经营者违法排放污染物，受到罚款处罚，被责令改正，拒不改正的，依法作出处罚决定的行政机关可以自责令改正之日的次日起，按照原处罚数额按日连续处罚。
前款规定的罚款处罚，依照有关法律法规按照防治污染设施的运行成本、违法行为造成的直接损失或者违法所得等因素确定的规定执行。
地方性法规可以根据环境保护的实际需要，增加第一款规定的按日连续处罚的违法行为的种类。
《中华人民共和国环境保护法》第六十条
企业事业单位和其他生产经营者超过污染物排放标准或者超过重点污染物排放总量控制指标排放污染物的，县级以上人民政府环境保护主管部门可以责令其采取限制生产、停产整治等措施;情节严重的，报经有批准权的人民政府批准，责令停业、关闭。
《中华人民共和国环境保护法》第六十三条
企业事业单位和其他生产经营者有下列行为之一，尚不构成犯罪的，除依照有关法律法规规定予以处罚外，由县级以上人民政府环境保护主管部门或者其他有关部门将案件移送公安机关，对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员，处十日以上十五日以下拘留;情节较轻的，处五日以上十日以下拘留：
(一)建设项目未依法进行环境影响评价，被责令停止建设，拒不执行的;
(二)违反法律规定，未取得排污许可证排放污染物，被责令停止排污，拒不执行的;
(三)通过暗管、渗井、渗坑、灌注或者篡改、伪造监测数据，或者不正常运行防治污染设施等逃避监管的方式违法排放污染物的;
(四)生产、使用国家明令禁止生产、使用的农药，被责令改正，拒不改正的。
以上就是我国法律上对于环境行政处罚责任人的具体认定情况，相关事项的认定下一方面是需要基于实际的涉案情况来处理，另一方面也需要对责任人的主体进行认定，特别是对于公司企业环境违法的，还需要对直接责任人进行处理。
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