1、环境行政处罚，是指环境保护行政机关依照环境保护法规，对犯有一般环境违法行为的个人或组织作出的具体的行政制裁措施。其直接结果是确定环境行政责任，包括罚款、责令停产等多种具体形式。广泛适用于不同的环境违法行为。根据中国环境保护法律法规的规定，环境违法的行政处罚只能由依法行使环境保护监督管理权的行政机关，按法定程序作出并付诸执行。被处罚的个人或组织如果不服，有权提起行政复议或行政诉讼。
2、行政处罚的主体是县级以上环境行政主管部门，其他依照法律规定行使环境监督管理权的行政部门，以及县级以上人民政府。应注意的是，这些行政主体只能实施环境法律规范规定的属于其监督管理范围内的行政处罚权，否则就是违法。
3、行政处罚的前提是管理相对人实施了违反环境法律规范的行为。也就是说，只有环境行政管理相对人实施了违反环境法律规范的行为，才能给予行政处罚，也只有环境法律规范规定必须或可以处罚的行为才可以处罚，法无明文不处罚。
(一)概念不同
环境行政处罚，是指环境保护行政机关依照环境保护法规，对犯有一般环境违法行为的个人或组织作出的具体的行政制裁措施。其直接结果是确定环境行政责任，包括罚款、责令停产等多种具体形式。广泛适用于不同的环境违法行为。
环境行政命令是环境行政机关极为重要的环境行政行为。从法的角度考察，环境行政命令是环境行政机关依法所作的具有强制拘束力的单方意思表示，体现环境管理中的国家权力作用。环境行政命令以环境法律为依据，不得与环境法律相抵触，适用环境法律的原理和原则而与环境法律密切联系.在制订机关、程序和名称、效力、地位上与环境法律又明显有别。
(二)处罚的形式不同
1、从实质上理解，行政命令是行政主体的一种强制性行为，只存在于行政处理行为之中，与行政检查、行政决定和行政强制执行相联系，并且相互衔接。我国《环境保护法》中规定的行政命令有责令停止违法行为、责令限制生产、责令停产整治、责令停业、关闭等。
第十二条 根据环境保护法律、行政法规和部门规章，责令改正或者限期改正违法行为的行政命令的具体形式有：
(1)责令停止建设;
(2)责令停止试生产;
(3)责令停止生产或者使用;
(4)责令限期建设配套设施;
(5)责令重新安装使用;
(6)责令限期拆除;
(7)责令停止违法行为;
(8)责令限期治理;
(9)法律、法规或者规章设定的责令改正或者限期改正违法行为的行政命令的其他具体形式。
2、而行政处罚是直接对行政相对人产生一定影响的行政措施。常见的行政处罚形式有拘留、罚款、暂扣或吊销执照等。环保部门最常使用的行政处罚措施是罚款。
我国《行政处罚法》第八条的规定，行政处罚不但包括“警告、罚款、行政拘留、没收违法所得、没收非法财物、暂扣或者吊销许可证、暂扣或者吊销执照”等能够直接对行政相对人产生影响的措施，还包括以“责令”开头的部分行政命令。
公民、法人或者其他组织，若是实施了违反环境保护法律、法规或者规章规定的行为，环境行政处罚机关需要按照《环境行政处罚办法》、《行政处罚法》之中规定的程序来作出行政处罚。
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